员工有权拒绝公司要求提交所有医疗资料原件去申请劳动能力鉴定的要求，并可以自行申请劳动能力鉴定。以下是从不同角度对此问题的详细分析：
法律角度
医疗资料原件的保管权：
- 医疗资料原件是员工个人隐私和权益的重要证明，员工对其享有保管权。除非法律另有规定或员工自愿，否则公司无权要求员工提交所有医疗资料原件。
劳动能力鉴定的申请主体：
- 根据《工伤保险条例》及相关规定，劳动能力鉴定应由工伤职工或者其近亲属、所在单位或者工会组织提出申请。这意味着员工本人有权自行申请劳动能力鉴定，无需完全依赖公司。
公司的协助义务：
- 虽然公司可以协助员工申请劳动能力鉴定，但这并不意味着公司可以强制要求员工提交所有医疗资料原件。公司可以要求员工提供必要的医疗资料复印件或协助员工获取相关医疗证明，但不应侵犯员工的保管权。
实际操作角度
保护个人隐私：
- 提交所有医疗资料原件可能涉及员工个人隐私的泄露风险。员工有权保护自己的隐私不受侵犯，因此可以拒绝公司的不合理要求。
自行申请的便利性：
- 员工自行申请劳动能力鉴定可以更加灵活地安排时间和流程，避免与公司产生不必要的纠纷和延误。同时，员工也可以更好地了解自己的鉴定进度和结果。
法律后果的考量：
- 如果公司强制要求员工提交所有医疗资料原件，并因此导致员工隐私泄露或其他不良后果，公司可能需要承担相应的法律责任。员工有权依法维护自己的合法权益。
建议与措施
与公司沟通：
- 员工可以与公司进行沟通，说明自己拒绝提交所有医疗资料原件的原因和依据，并寻求公司的理解和支持。同时，员工也可以提出合理的解决方案，如提供医疗资料复印件或协助公司获取相关医疗证明。
自行申请劳动能力鉴定：
- 如果公司坚持要求员工提交所有医疗资料原件，员工可以选择自行申请劳动能力鉴定。在申请过程中，员工需要按照相关规定提交必要的医疗资料和证明文件，并遵循鉴定机构的流程和要求。
寻求法律援助：
- 如果员工在申请劳动能力鉴定过程中遇到困难或纠纷，可以寻求法律援助或咨询专业律师的意见。律师可以根据具体情况为员工提供法律建议和支持，帮助员工维护自己的合法权益。
总结来说，员工有权拒绝公司要求提交所有医疗资料原件去申请劳动能力鉴定的要求，并可以自行申请劳动能力鉴定。在处理此类问题时，员工应保护自己的个人隐私和合法权益，同时遵循相关法律法规和鉴定机构的要求。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。