从横向课题中提取绩效劳务费是否合法，需结合具体情况及相关法律法规综合判断，以下分情况说明：

1. 若提取行为符合合同约定及单位规章制度：

   • 法律依据：根据《中华人民共和国劳动合同法》及相关劳动法规，用人单位与劳动者在劳动合同中可以约定劳动报酬的构成及支付方式。若横向课题的绩效劳务费提取方式在劳动合同中有明确约定，或者该提取方式符合用人单位依法制定的规章制度，且这些规章制度已经过民主程序制定并公示或告知劳动者，则该提取行为通常是合法的。
   • 实际操作：在此情况下，劳动者应按照合同约定或规章制度的规定，接受绩效劳务费的提取方式。若对提取方式有疑问或异议，可与用人单位协商解决。

2. 若提取行为违反合同约定或单位规章制度：

   • 法律后果：如果横向课题的绩效劳务费提取方式违反了劳动合同中的约定或用人单位的规章制度，或者这些规章制度本身存在违法情形（如未经过民主程序制定、未公示或告知劳动者等），则该提取行为可能构成违法。劳动者有权要求用人单位按照合同约定或法律规定支付劳动报酬，并可能因此向劳动监察部门投诉或提起劳动仲裁。
   • 实际操作建议：劳动者在发现用人单位存在违法提取绩效劳务费的行为时，应首先收集相关证据（如劳动合同、规章制度、工资条等），然后与用人单位进行协商。若协商无果，可向当地劳动监察部门投诉或依法提起劳动仲裁，以维护自己的合法权益。

3. 若提取行为涉及税收问题：

   • 税务合规：无论绩效劳务费的提取方式是否合法，用人单位和劳动者都应确保该行为符合税收法律法规的规定。用人单位在支付绩效劳务费时，应依法代扣代缴个人所得税；劳动者在收到绩效劳务费后，也应按照税法规定申报并缴纳个人所得税。
   • 法律风险：若用人单位或劳动者未依法履行税收义务，可能面临税务机关的处罚，包括但不限于补缴税款、滞纳金、罚款等。在严重情况下，还可能构成逃税罪等刑事犯罪。

总结与建议：

• 从横向课题中提取绩效劳务费是否合法，需根据合同约定、单位规章制度以及税收法律法规进行综合判断。
• 劳动者在遇到相关问题时，应首先了解自己的劳动合同和单位规章制度，确保自己的权益不受侵害。
• 若对提取方式有疑问或异议，或发现用人单位存在违法提取行为，应及时与用人单位协商解决，并保留好相关证据以备不时之需。
• 在处理此类问题时，建议咨询专业律师以获取更具体的法律建议和指导。

如有任何进一步的问题或需要法律帮助，请随时向我咨询。