结算审核是否要扣违约金，这主要取决于合同中的具体约定以及实际履行情况。以下从不同角度为你详细分析：

1. 合同有明确约定：

   • 如果合同中明确规定了结算审核时若存在特定情形（如逾期付款、未达到合同约定的质量标准等），则需扣除一定比例的违约金，那么在这种情况下，结算审核时确实需要按照合同约定扣除相应的违约金。
   • 示例：甲乙双方签订了一份采购合同，合同中约定若乙方逾期交货，则每逾期一天需支付合同总价款0.1%的违约金。在结算审核时，若发现乙方确实存在逾期交货的情况，那么甲方有权按照合同约定扣除相应的违约金。

2. 合同无明确约定，但存在法定情形：

   • 如果合同中没有明确约定结算审核时需扣除违约金的情形，但根据相关法律法规的规定，一方存在违约行为且给对方造成损失的，应当承担赔偿责任。在这种情况下，虽然合同没有直接约定扣除违约金，但违约方仍需根据法律规定承担相应的赔偿责任，这种赔偿责任在结算审核时可能会以扣除款项的形式体现。
   • 法律依据：根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，当事人一方不履行合同义务或者履行合同义务不符合约定的，应当承担继续履行、采取补救措施或者赔偿损失等违约责任。

3. 合同无明确约定，也无法定情形：

   • 如果合同中没有明确约定结算审核时需扣除违约金的情形，且根据相关法律法规的规定，一方也不存在违约行为或无需承担赔偿责任，那么在这种情况下，结算审核时通常不需要扣除违约金。

建议：

• 在签订合同时，双方应尽可能明确约定结算审核时可能涉及的各种情形及相应的处理方式，包括是否扣除违约金、扣除的比例和条件等，以避免后续产生纠纷。
• 在结算审核过程中，双方应严格按照合同约定和相关法律法规的规定进行操作，确保结算审核的公正性和合理性。
• 如果对结算审核结果存在异议或争议，双方可以通过协商、调解、仲裁或诉讼等方式解决纠纷。

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