结论：针对您在同程上预订酒店退款被拒绝，但商家已同意退款的情况，您可以采取以下措施来处理：首先与同程平台再次沟通确认退款事宜；若平台不作为，可向商家直接确认退款细节；同时，保留好所有相关证据，必要时可向消费者协会投诉或通过法律途径解决。

详细分析与建议：

1. 与同程平台再次沟通：

   • 既然商家已经同意退款，但同程平台却拒绝了您的退款申请，这可能是由于平台与商家之间的信息同步问题或平台内部流程导致的。
   • 您应再次联系同程平台的客服，明确告知商家已同意退款的情况，并要求平台重新审核您的退款申请。
   • 在沟通过程中，保持冷静和礼貌，详细阐述问题经过，并提供商家同意退款的证据（如聊天记录、邮件等）。

2. 向商家直接确认：

   • 如果与同程平台的沟通没有结果，您可以尝试直接联系商家，确认退款的具体流程和时间。
   • 商家可能已经将退款信息提交给了同程平台，但由于某种原因（如系统故障、人为错误等）未能及时处理。
   • 通过与商家的直接沟通，您可以更清楚地了解退款进度，并可能获得更直接的解决方案。

3. 保留证据并投诉：

   • 在整个过程中，务必保留好所有与退款相关的证据，包括预订记录、付款凭证、商家同意退款的证据等。
   • 如果同程平台和商家均未能给出满意的解决方案，您可以向当地的消费者协会或相关监管部门投诉，寻求帮助。
   • 投诉时，提供详细的证据和情况说明，以便相关部门能够更准确地了解问题并给出处理意见。

4. 考虑法律途径：

   • 如果上述方法均未能解决问题，且您认为自己的合法权益受到了侵害，您可以考虑通过法律途径来维护自己的权益。
   • 根据《中华人民共和国消费者权益保护法》等相关法律法规，消费者在购买商品或接受服务时享有合法权益，包括退款权等。
   • 您可以咨询专业律师（即向我咨询），了解具体的法律程序和维权策略，并考虑是否提起诉讼或申请仲裁等。

后续行动建议：

• 在处理此类问题时，务必保持冷静和理性，避免情绪化的行为或言论。
• 及时与相关方沟通并保留好所有证据，以便在需要时能够提供有力的支持。
• 如果问题复杂或涉及金额较大，建议尽早咨询专业律师以获取更具体的法律建议和支持。