结论：网吧网络文化经营许可证的转让及配合过户行为是否违法，需根据具体情况判断，一般情况下，未经许可擅自转让是违法的，但若符合法定条件并履行相关手续，则可能合法。以下从不同角度详细分析：
一、许可证的转让性质
网络文化经营许可证是网吧开展网络文化经营活动的法定凭证，具有专属性，通常与特定的经营主体、场所、设备等紧密相关。根据相关法律法规，许可证的转让并非简单的证件过户，而是涉及经营主体、经营条件等多方面的变更。因此，不能仅凭“转让许可证并配合过户”这一行为本身来判断其合法性，而需结合转让的具体内容、方式及是否履行了相关手续等因素进行综合判断。
二、违法性的判断标准
未经许可擅自转让：
- 如果网吧在未经相关主管部门许可的情况下，擅自将网络文化经营许可证转让给乙方，并配合乙方进行证件过户，这种行为很可能构成违法。因为许可证的转让需要满足一定的条件，并经过主管部门的审核批准，未经许可擅自转让可能扰乱市场秩序，损害公共利益。
符合法定条件并履行相关手续：
- 如果网吧的转让行为符合相关法律法规规定的条件，如转让方和受让方均具备从事网络文化经营活动的资质、转让行为不会对市场秩序和公共利益造成不良影响等，并且已经按照法定程序向主管部门提出了转让申请，并获得了批准，那么这种转让行为就是合法的。在这种情况下，网吧配合乙方进行证件过户也是合法的。
三、法律后果与风险提示
违法后果：
- 如果网吧的转让行为被认定为违法，可能会面临主管部门的行政处罚，如罚款、吊销许可证等。同时，如果转让行为给第三方造成了损失，网吧还可能需要承担民事赔偿责任。
风险提示：
- 在进行网络文化经营许可证的转让时，网吧应务必确保转让行为符合相关法律法规的规定，并履行了必要的手续。建议网吧在转让前咨询相关主管部门或专业律师，了解转让的具体要求和程序，以避免因违法转让而带来的法律风险。
四、合法转让的建议流程
如果网吧确实需要转让网络文化经营许可证，建议按照以下流程进行：
评估转让条件：
- 评估转让方和受让方是否均具备从事网络文化经营活动的资质和条件。
签订转让协议：
- 双方签订书面转让协议，明确转让的具体内容、方式、价格及双方的权利义务等。
向主管部门申请转让：
- 按照相关法律法规的规定，向主管部门提出转让申请，并提交必要的材料。
等待审核批准：
- 等待主管部门对转让申请进行审核，并根据审核结果决定是否批准转让。
办理过户手续：
- 如果转让申请获得批准，双方应按照主管部门的指示办理证件过户手续。
最后，网吧网络文化经营许可证的转让及配合过户行为是否违法，需根据具体情况判断。如果你在这方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。