结论前置：甲方将营业执照转让给乙方并配合乙方所有证件过户的行为，在大多数情况下是违法的，且存在诸多法律风险和后果。

详细分析：

1. 营业执照的转让性：

   • 营业执照是公司合法经营的凭证，它代表了公司的身份和经营资格。根据《中华人民共和国公司法》及相关法律法规，营业执照本身并不具备直接转让的属性。公司的设立、变更、注销等事项，均需依法向工商行政管理部门办理相关登记手续。
   • 若甲方试图将营业执照“转让”给乙方，实际上可能是在试图转让公司的经营权或股权，但这必须通过合法的股权转让或公司合并、分立等程序来实现，而非简单地“转让”营业执照。

2. 证件过户的合法性：

   • 证件过户，如税务登记证、组织机构代码证等，同样需要依法进行变更登记。这些证件是公司运营过程中必不可少的法律文件，它们的变更必须遵循相关法律法规的规定。
   • 甲方配合乙方进行证件过户，如果这一行为是在合法框架内进行的，如按照股权转让协议或公司合并、分立协议办理相关变更登记，那么这一行为是合法的。但如果脱离了合法框架，如未经批准擅自转让或伪造文件进行过户，则构成违法行为。

3. 违法行为的法律后果：

   • 如果甲方和乙方的行为被认定为违法，他们可能面临行政处罚，如罚款、吊销营业执照等。
   • 在严重情况下，如果这一行为涉及欺诈、伪造文件等犯罪行为，相关责任人还可能面临刑事处罚。
   • 此外，违法转让营业执照和证件过户还可能导致公司运营中断、合同违约等民事纠纷，给公司带来经济损失和声誉损害。

4. 合法途径的建议：

   • 如果乙方希望获得甲方的公司经营权或股权，应该通过合法的股权转让程序来实现。这包括签订股权转让协议、办理工商变更登记等步骤。
   • 在股权转让过程中，双方应确保所有文件的真实性和合法性，避免使用伪造或虚假文件。
   • 如果涉及公司合并或分立，同样需要遵循相关法律法规的规定，办理相关登记手续。

进一步思考：

• 在进行公司经营权或股权转让时，双方应充分了解相关法律法规和政策要求，确保转让行为的合法性和有效性。
• 双方可以寻求专业律师或法律机构的帮助，以确保转让过程的顺利进行和法律风险的防控。
• 在转让过程中，双方应保持诚信和透明，避免隐瞒重要信息或进行欺诈行为。

总结与建议：

甲方将营业执照转让给乙方并配合乙方所有证件过户的行为，在大多数情况下是违法的，且存在诸多法律风险和后果。如果乙方希望获得甲方的公司经营权或股权，应该通过合法的股权转让程序来实现，并确保所有文件的真实性和合法性。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。