结论：您儿子与对方在学校打架且双方都还手，在法律上通常会被认定为互殴行为。由于双方均未受伤，且涉及的是未成年人，一般情况下不会直接立案处理，而是会通过学校、家长或教育部门进行调解。若确实涉及到了立案程序，后续处理会依据具体情况和调解结果来定。

详细分析：

1. 互殴行为的认定：

   • 互殴是指双方或多方之间，出于故意或过失，通过暴力手段相互攻击对方的行为。在您儿子与对方打架且双方都还手的情况下，这符合互殴的基本特征。
   • 需要注意的是，互殴与正当防卫是不同的。正当防卫是指为了使国家、公共利益、本人或者他人的人身、财产和其他权利免受正在进行的不法侵害，而采取的制止不法侵害的行为。在您儿子的情况中，如果双方是出于争执而互相攻击，且没有一方是在制止另一方的不法侵害，那么通常不会被认定为正当防卫。

2. 未成年人打架的处理：

   • 由于您儿子和对方都是未成年人（12岁），根据《中华人民共和国未成年人保护法》和《中华人民共和国预防未成年人犯罪法》的相关规定，对于未成年人的打架行为，应当优先考虑教育、挽救和感化的原则，而不是直接采取惩罚措施。
   • 在实践中，学校、家长或教育部门通常会先进行调解，尝试通过沟通、教育等方式解决双方之间的矛盾，避免事态进一步恶化。

3. 立案后的处理：

   • 如果双方打架行为确实严重到了需要立案的程度（尽管在您描述的情况下这不太可能，因为双方均未受伤），那么公安机关会依法进行调查取证，并根据调查结果作出相应的处理决定。
   • 对于未成年人之间的打架行为，即使立案，也通常会倾向于采取教育、警告等非刑罚处罚措施，而不是直接追究刑事责任或进行行政处罚。
   • 如果双方家长或学校能够达成调解协议，并且该协议得到了双方的认可和执行，那么公安机关也可能会根据调解结果来作出相应的处理决定，如不予处罚或从轻处罚等。

建议：

• 加强沟通：作为家长，您应该与对方家长、学校以及可能涉及的教育部门进行沟通，了解事情的具体经过和原因，并尝试通过沟通解决问题。
• 教育引导：对您儿子进行适当的教育和引导，让他明白打架行为的不当之处，并教会他如何正确处理与同学之间的矛盾和冲突。
• 关注后续：如果事情确实涉及到了立案程序或其他法律后果，您应该密切关注后续的处理情况，并在必要时寻求专业法律帮助。

如果您在处理此事过程中遇到任何法律问题或需要进一步的法律建议，请随时向我咨询。