结论：小区地下车库规划的摩托车位停电动车收费是否合法，需结合具体情况判断，主要从规划用途、管理规约、收费依据及程序合法性等角度分析。以下为详细解答：

1. 规划用途是否允许变更

• 法律背景：根据《民法典》第276条，建筑区划内规划用于停放汽车的车位、车库应当首先满足业主的需要。若摩托车位规划用途明确为“摩托车专用”，则物业擅自将其用于电动车停放可能涉嫌违规，除非经业主共同决定或规划部门批准变更用途。
• 建议：业主可要求物业出示规划图纸或变更审批文件，确认车位用途是否合法调整。若未变更规划，物业无权单方面改变用途并收费。

2. 管理规约或业主大会决议是否授权

• 法律背景：根据《物业管理条例》第17条，业主大会或业主委员会可制定管理规约，对物业使用、维护等事项作出约定。若管理规约明确允许摩托车位停放电动车并授权收费，则物业行为可能合法。
• 建议：业主应查阅小区管理规约或业主大会决议，确认是否存在相关授权条款。若无授权或条款模糊，物业收费可能缺乏依据。

3. 收费依据及程序是否合法

• 法律背景：
  • 收费标准：根据《物业服务收费管理办法》，物业收费需遵循合理、公开及费用与服务水平相适应原则。若收费标准未经物价部门备案或未公示，可能涉嫌违规。
  • 程序合法性：根据《民法典》第278条，改变共有部分的用途或利用共有部分从事经营活动，需经专有部分面积占比三分之二以上的业主且人数占比三分之二以上的业主参与表决，并经参与表决专有部分面积过半数的业主且参与表决人数过半数的业主同意。
• 建议：
  • 要求物业出示收费备案证明及公示材料；
  • 若收费涉及共有部分经营，需确认是否经业主共同决定程序。

4. 特殊情形：人防车位或产权车位

• 人防车位：若摩托车位属于人防工程，根据《人民防空法》，平时由投资者使用管理，收益归投资者所有。但使用需符合“战时可用”要求，且不得影响防空功能。若物业将人防车位用于电动车停放并收费，需确认是否经人防主管部门批准。
• 产权车位：若摩托车位为开发商所有（如产权车位），开发商有权自主决定使用方式及收费标准，但需遵守《消费者权益保护法》中关于公平交易的规定，不得设置不合理条件。

5. 业主维权路径

• 协商：与物业沟通，要求出示合法依据；
• 投诉：向当地房管部门或物价部门举报违规收费；
• 诉讼：若物业行为损害业主权益，可依据《民法典》第286条起诉要求停止侵害、返还费用或赔偿损失。

总结：物业在摩托车位停放电动车并收费是否合法，需结合规划用途、管理规约、收费依据及程序综合判断。建议业主先核查相关文件，再通过协商、投诉或诉讼维护权益。如有进一步疑问，可直接向我咨询。