结论前置：针对小区规约中规定门窗业主不能私自更换，但业主已经更换的情况，可以从以下几个角度进行分析和处理：
规约的效力与业主行为：
- 规约效力：小区规约是业主共同制定并遵守的行为准则，对全体业主具有约束力。如果规约中明确规定了门窗不能私自更换，那么这一规定在规约有效期内对所有业主都是适用的。
- 业主行为：业主私自更换门窗，可能违反了小区规约。这种行为可能引发其他业主的不满，甚至可能导致物业或业主委员会采取相应的管理措施。
可能的法律后果：
- 物业或业主委员会的行动：物业或业主委员会在发现业主私自更换门窗后，可能会要求业主恢复原状，或者采取其他管理措施，如罚款、限制使用某些设施等。具体措施取决于规约中的规定以及物业或业主委员会的决策。
- 相邻权纠纷：如果更换门窗的行为影响了其他业主的正常生活或造成了损害，其他业主可能会依据相邻权的相关规定，要求更换门窗的业主承担相应的法律责任，如赔偿损失、恢复原状等。
处理建议：
- 与物业或业主委员会沟通：如果业主已经更换了门窗，建议首先与物业或业主委员会进行沟通，说明情况并寻求解决方案。如果更换门窗是出于必要的原因（如安全、节能等），可以尝试与物业或业主委员会协商，看是否能够得到理解或支持。
- 恢复原状或协商补偿：如果物业或业主委员会要求恢复原状，业主应考虑配合执行。如果确实无法恢复原状，或者恢复原状的成本过高，可以尝试与物业或业主委员会协商补偿方案，以达成双方都能接受的解决方案。
- 寻求法律援助：如果业主与物业或业主委员会之间无法达成一致，或者业主认为自己的权益受到了侵害，可以寻求法律援助。作为专业律师，我可以根据具体情况提供法律咨询和代理服务，帮助业主维护自己的合法权益。
额外提醒：在处理此类问题时，业主应充分了解小区规约的内容，并遵守相关规定。如果认为规约中的某些条款不合理或存在争议，可以通过合法途径提出修改建议或寻求法律救济。同时，业主在更换门窗等涉及公共利益的事项时，应充分考虑其他业主的意见和利益，避免引发不必要的纠纷。
后续行动建议：如果您作为业主已经更换了门窗，并且面临物业或业主委员会的管理措施或其他业主的投诉，建议您及时与我联系，提供详细情况，以便我能够为您提供更具体的法律建议和帮助。