定向村医第三年违约需赔偿的金额，需根据具体合同条款、地方政策及实际损失综合确定，无法直接给出固定数额，但可分以下情况分析：

1. 合同约定优先
   若定向培养协议中明确约定了违约责任（如“服务期未满提前离职需支付违约金X万元”），则以合同条款为准。但需注意：

   • 违约金金额需合理，不得超过用人单位实际支付的培训费用（如学费、生活补贴等）及因违约造成的直接损失；
     
   • 若合同未约定违约金，但约定了“赔偿实际损失”，则需由用人单位举证损失金额（如重新招聘成本、培训费用分摊等）。
     

2. 地方政策影响
   部分省份对定向村医有专项规定（如《XX省农村订单定向医学生免费培养工作实施办法》），可能明确违约金计算方式。例如：

   • 按未履行服务年限比例退还已享受的减免费用（如学费、住宿费）；
     
   • 额外支付一定比例的赔偿金（如未满服务期每年赔偿2万元）。
     建议：查询当地卫健委或人社局发布的最新政策文件，或提供省份名称，我可进一步分析。
     

3. 实际损失补充
   即使合同或政策未明确金额，用人单位仍可主张实际损失赔偿，包括：

   • 直接损失：已支付的培训费用、招聘替代人员的费用；
     
   • 间接损失：因村医离职导致的医疗服务缺口造成的社会影响（需举证）。
     

行动建议：

1. 立即查阅定向培养协议原文，重点查看“违约责任”条款；
   
2. 联系当地卫健委或签约单位，确认地方政策对违约金的特殊规定；
   
3. 若对赔偿金额有争议，可委托律师协助核算合理赔偿范围，避免过度赔偿。
   

如有具体合同条款或地方政策文件，可提供进一步分析。