员工六月份申请年假时，年假的计算方式主要依据《职工带薪年休假条例》及相关规定，具体计算方法如下：

1. 年假天数确定：

   • 根据员工累计工作年限确定年假天数。累计工作已满1年不满10年的，年休假5天；已满10年不满20年的，年休假10天；已满20年的，年休假15天。
   • 这里的“累计工作年限”是指员工自参加工作以来的总年限，不仅限于当前单位的工作年限。

2. 年假计算周期：

   • 年假通常按自然年度计算，即从每年的1月1日至12月31日。
   • 如果员工在六月份入职或离职，其年假天数可能需要根据实际在职天数进行折算。但如果是六月份申请年假，且员工已在该单位工作满一个完整年度，则直接按上述累计工作年限确定年假天数。

3. 年假申请与安排：

   • 员工在六月份申请年假时，应提前与单位协商并确定休假时间。单位应根据生产、工作的具体情况，并考虑员工本人意愿，统筹安排年假。
   • 如果单位因生产、工作特点确有必要跨年度安排员工年休假的，可以跨1个年度安排，但应征得员工本人同意。

4. 年假未休的补偿：

   • 如果单位确因工作需要不能安排员工休年假的，经员工本人同意，可以不安排员工休年假。但对员工应休未休的年假天数，单位应当按照该员工日工资收入的300%支付年休假工资报酬，其中包含单位支付员工正常工作期间的工资收入。

举例说明：

• 假设员工A累计工作年限为8年，那么他在六月份申请年假时，应享有5天的年假。
• 如果员工B在六月份入职，且之前在其他单位已累计工作满12年，那么他在当前单位工作满一年后（即次年六月份后），应享有10天的年假。但如果在六月份入职当年即申请年假，可能需要根据实际在职天数进行折算（具体折算方法需根据单位规定或当地劳动法规确定）。

建议：

• 员工在申请年假前，应先了解自己的累计工作年限和单位关于年假的具体规定。
• 与单位协商年假申请时，应明确休假时间、天数及未休年假的补偿方式等事项。
• 如遇单位不安排年假或未支付未休年假工资报酬的情况，员工可依法向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。