结论：建设单位伙同他人将个人借贷强加入工程款扣除的行为，是否构成诈骗，需根据具体行为特征和法律要件进行综合判断，不能一概而论。以下从不同角度进行分析：
一、诈骗罪的构成要件
诈骗罪是指以非法占有为目的，用虚构事实或者隐瞒真相的方法，骗取数额较大的公私财物的行为。其构成要件包括：
- 主观方面：具有非法占有的目的。
- 客观方面：实施了虚构事实或隐瞒真相的行为，使被害人产生错误认识，并基于该错误认识处分财产，行为人因此取得财产。
二、行为分析
虚构事实或隐瞒真相：
- 若建设单位伙同他人，通过伪造文件、虚构债务或隐瞒真实借贷情况等手段，将个人借贷错误地计入工程款中，并以此为由进行扣除，这可能构成虚构事实或隐瞒真相。
使被害人产生错误认识：
- 如果这种虚构或隐瞒的行为导致工程款的支付方（如承包商或业主）产生了错误认识，认为该扣除是合法或合理的，从而同意或未反对该扣除，则满足了诈骗罪的这一要件。
处分财产与取得财产：
- 支付方基于错误认识处分了本应支付给承包商或用于工程的其他款项，而建设单位或其同伙因此取得了这部分财产，这符合诈骗罪中“处分财产”与“取得财产”的要件。
三、不构成诈骗的例外情况
存在合法依据：
- 如果建设单位能够证明该个人借贷确实与工程款有关，且扣除行为有合法的合同依据或法律规定，那么这种行为可能不构成诈骗。
无非法占有目的：
- 如果建设单位扣除工程款并非出于非法占有的目的，而是由于误解、疏忽或其他非故意原因，那么这种行为也不构成诈骗。
四、法律建议
收集证据：
- 如果认为建设单位的行为构成诈骗，应尽快收集相关证据，包括合同、付款记录、通信记录等，以证明虚构事实或隐瞒真相的行为以及非法占有的目的。
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考虑报案或诉讼：
- 如果证据充分，且符合诈骗罪的构成要件，可以考虑向公安机关报案或向法院提起诉讼，以维护自身合法权益。
五、可能的法律后果
刑事责任：
- 如果建设单位的行为被认定为诈骗罪，将可能面临刑事处罚，包括有期徒刑、罚金等。
民事责任：
- 无论是否构成诈骗罪，建设单位都可能因违反合同或法律规定而承担民事责任，如赔偿损失、恢复原状等。