面对违建发出的催告书，若您认为其存在不合法之处，可以按照以下步骤来处理，以维护自己的合法权益：

一、仔细审查催告书内容

首先，您需要仔细研读催告书，确认其是否存在不合法情形。这包括但不限于：

1. 主体是否合法：检查发出催告书的主体是否具备法定的职权，如是否为规划部门、城管部门等有权机关。

2. 事实认定是否清晰：确认催告书中对“违章建筑”的描述是否准确，是否清晰说明了认定的具体事实，如建筑的面积、位置等关键信息。

3. 法律适用是否正确：检查催告书引用的法律法规条文是否正确、准确，是否未将合法建设错误地套用到禁止性规定中，或适用已失效的法规条款。

4. 程序是否合法：确认相关部门是否依法进行了调查取证，并保障了您的陈述、申辩权利。

二、采取具体应对措施

在确认催告书存在不合法情形后，您可以采取以下具体措施：

1. 提出异议：

   • 在规定期限内，按照法定程序向相关部门提出书面异议，详细陈述您的观点和理由，要求重新审查或撤销催告书。
   • 异议内容应详实、有理有据，附上相关法律法规和证据支持，如建设工程规划许可证、土地使用证等。

2. 咨询专业律师：

   • 寻求专业律师的帮助，对催告书进行更深入的法律分析，获取针对性的法律建议。
   • 律师可以协助您准备异议材料、申请行政复议或提起行政诉讼，提供专业的法律代理服务。

3. 申请行政复议：

   • 如果异议未被接受，您可以在法定期限内向上一级行政机关或同级人民政府申请行政复议。
   • 复议申请应详细阐述催告书不合法的具体理由和证据，要求复议机关撤销该催告书。

4. 提起行政诉讼：

   • 若行政复议未能解决问题，您还可以在收到复议决定或法定复议期限届满之日起15日内，向有管辖权的人民法院提起行政诉讼。
   • 通过司法途径，由法院对催告书的合法性进行最终审查和判定。

三、注意事项

在处理此类问题时，您还需注意以下几点：

• 保持冷静和理性：遵循法律程序，避免采取过激行为，以免对自身造成不利影响。

• 保存证据：务必保存好与建筑相关的各类证据，如建设过程中的材料、文件、与相关部门的沟通记录等，以备不时之需。

• 积极配合调查：在提出异议和申请复议的同时，也应积极配合相关部门的调查和处理工作，以展现您的诚意和合作态度。

综上所述，面对违建发出的催告书，若您认为其存在不合法之处，应通过详细审查、提出异议、申请行政复议或提起行政诉讼等途径来维护自己的合法权益。同时，保持冷静理性、保存证据并积极配合调查也是至关重要的。希望这些建议能对您有所帮助。