结论前置：国家法定假日休息，用人单位不应扣除劳动者的底薪。若在法定假日安排劳动者工作，则需支付不低于工资的百分之三百的工资报酬作为加班费。
详细分析：
法定假日的底薪支付：
- 根据《中华人民共和国劳动法》的相关规定，法定节假日是劳动者依法享有的休息日。在此期间，即使劳动者没有实际出勤，用人单位也需按照劳动合同约定的正常工资标准支付底薪。这是因为法定节假日是法律规定的休息时间，劳动者享有休息的权利，而用人单位则有义务支付相应的工资作为保障。
- 月计薪天数的计算公式为（365天-104天）÷12月=21.75天，其中104天为一年52周的周末休息日总数。因此，在计算法定节假日应支付的工资时，需将月工资除以月计薪天数再乘以法定节假日天数，以确保劳动者在法定节假日期间也能获得相应的工资报酬。
法定假日加班的工资支付：
- 如果在法定休假日安排劳动者工作，用人单位必须支付不低于工资的百分之三百的工资报酬作为加班费。这一规定体现了对劳动者休息权利的特别保护，旨在防止用人单位过度利用劳动者的劳动力，确保劳动者能够得到充分的休息和合理的报酬。
- 举例来说，若劳动者的月工资（底薪）为5000元，每月计薪天数按21.75天计算，则日工资约为229.89元。若劳动者在法定节假日加班一天，用人单位应额外支付689.67元的加班费（229.89×3），加上原本的日工资，当天共可获得约919.56元。
法律建议：
- 劳动者应了解自己的权益，确保在法定节假日期间获得应有的工资报酬。若用人单位存在扣除底薪或未支付加班费的行为，劳动者可以通过与用人单位协商、向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁等途径维护自身权益。
- 用人单位也应严格遵守法律法规，确保在法定节假日期间支付劳动者相应的工资报酬和加班费，以维护劳动者的合法权益和企业的良好形象。
可能法律后果：
- 若用人单位违反法律法规，在法定节假日期间扣除劳动者底薪或未支付加班费，将可能面临劳动监察部门的处罚和劳动者的法律诉讼，这不仅会影响企业的声誉和运营，还可能承担相应的法律责任和经济损失。
综上所述，国家法定假日休息时，用人单位不应扣除劳动者的底薪。若在法定假日安排劳动者工作，则需按照法律规定支付加班费。劳动者应了解自己的权益，并在必要时采取合法途径维护自身利益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。