起诉小三开庭时结婚证丢了，一般情况下不会直接影响开庭，但可能会给诉讼过程带来一些不便，需要及时采取补救措施。以下从不同角度为你详细分析：

法律程序角度

在起诉涉及婚姻关系的案件（如起诉小三可能涉及的侵权、返还财产等纠纷，这些纠纷往往与婚姻关系紧密相连）时，结婚证是证明婚姻关系存在的重要证据。不过，它并非诉讼程序启动和进行的唯一必备文件。根据《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，起诉需要提交起诉状以及与案件相关的证据材料等。结婚证丢失并不意味着无法证明婚姻关系，还有其他方式可以替代或补充证明。

证明婚姻关系的其他方式

1. 到婚姻登记机关补办或开具证明：你可以前往原办理婚姻登记的机关，申请补办结婚证或者开具婚姻关系证明。婚姻登记机关通常会有婚姻登记档案，能够根据你的申请出具相应的证明文件，这些文件在法律上具有与结婚证同等的效力，可以用于证明婚姻关系。
2. 提供其他相关证据：除了结婚证和婚姻登记机关的证明外，你还可以收集其他能够证明婚姻关系的证据，如户口簿（上面一般会登记婚姻状况）、夫妻共同财产的证明（如房产证、车辆行驶证等，上面可能登记有夫妻双方的名字）、子女出生证明（上面有父母的信息）等。这些证据可以相互印证，形成完整的证据链，证明婚姻关系的存在。

实际操作建议

1. 尽快补办或开具证明：一旦发现结婚证丢失，应立即前往婚姻登记机关办理相关手续，以免耽误诉讼进程。在补办或开具证明的过程中，要按照婚姻登记机关的要求提供必要的材料和信息。
2. 整理其他证据：在等待补办结婚证或开具证明的同时，你可以开始整理其他能够证明婚姻关系的证据。将这些证据进行分类整理，并制作证据清单，以便在开庭时能够清晰、有条理地向法庭展示。
3. 与律师沟通：如果你聘请了律师，应及时将结婚证丢失的情况告知律师，让律师协助你处理相关事宜。律师可以根据你的具体情况，为你提供专业的法律建议和指导，帮助你更好地应对诉讼。

总结来说，结婚证丢失虽然可能会给诉讼带来一些麻烦，但并不是无法解决的问题。通过及时采取补救措施，提供其他能够证明婚姻关系的证据，你仍然可以顺利进行诉讼。如果你还有其他疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询，我会尽我所能为你提供专业的法律服务。