结论：在政府采购询价中，若报价单位是总公司，一般情况下应由总公司来签订合同，但在特定条件下，分公司也可以签订合同。以下是对此问题的详细分析：
一、总公司作为报价单位的基本原则
在政府采购询价过程中，报价单位通常是参与竞标的主体，也是后续合同签订的主要方。若报价单位是总公司，那么从法律逻辑和合同一致性的角度出发，原则上应由总公司来签订合同。这是因为总公司作为独立的法人实体，具有签订合同的法律资格和责任能力。
二、分公司签订合同的特定条件
尽管总公司是报价单位，但在某些特定条件下，分公司也可以签订合同。这些条件主要包括：
分公司具有独立签订合同的资格：
- 根据《公司法》及相关法律法规，分公司虽然不具有独立的法人资格，但在总公司的授权范围内，可以从事一定的民事活动，包括签订合同。
- 若分公司已经取得了总公司的明确授权，且该授权范围涵盖了签订政府采购合同，那么分公司就有权签订合同。
政府采购项目的特殊性：
- 在某些政府采购项目中，可能由于项目性质、地域限制或其他特殊原因，需要由分公司来具体执行合同。
- 在这种情况下，若总公司同意并授权分公司签订合同，且该授权符合政府采购的相关规定，那么分公司签订合同也是可行的。
合同履行的便利性：
- 若分公司位于项目所在地或附近，且具备履行合同所需的资源、能力和条件，那么由分公司签订合同可能更有利于合同的顺利履行。
- 在这种情况下，总公司可以考虑授权分公司签订合同，以简化合同履行过程中的管理流程和沟通成本。
三、法律建议与风险提示
明确授权范围：
- 若总公司决定授权分公司签订合同，应明确授权范围、期限和条件等，并确保授权文件合法有效。
- 授权文件应作为合同附件或补充协议，以明确双方的权利和义务。
遵守政府采购规定：
- 在签订政府采购合同时，应严格遵守政府采购的相关法律法规和政策要求。
- 确保合同内容、签订程序等符合政府采购的规定，以避免因违规操作而引发的法律风险。
加强合同管理：
- 无论是总公司还是分公司签订合同，都应加强合同管理，确保合同条款明确、具体、合法有效。
- 在合同履行过程中，应密切关注合同履行情况，及时处理可能出现的问题和纠纷。
考虑税务和财务影响：
- 分公司签订合同可能涉及税务和财务方面的问题，如税务登记、发票开具、资金流转等。
- 在签订合同前，应充分考虑这些因素，并咨询专业税务和财务人员的意见，以确保合同签订和履行的合法性和合规性。
总结来说，虽然总公司作为报价单位原则上应由其签订合同，但在特定条件下分公司也可以签订合同。在决定是否由分公司签订合同时，应综合考虑授权范围、政府采购规定、合同履行便利性以及税务和财务影响等因素。如有任何疑问或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。