针对您提出的“交通事故伤残鉴定自己鉴定后保险公司不认可，法院指定后是否是最终的”这一问题，以下是我的详细解答：

首先，需要明确的是，双方自行指定的伤残鉴定结果并非必然被保险公司认可。保险公司是否认可，会综合考虑鉴定机构的资质、鉴定程序的合规性、鉴定结论的合理性，以及是否与保险公司事先沟通等因素。如果自行鉴定的结果在这些方面存在瑕疵或不足，保险公司有权不认可，并可能要求重新进行鉴定。

当自行鉴定的结果不被保险公司认可时，您可以采取以下步骤来维护自己的合法权益：

1. 明确不认可原因：

   • 与保险公司沟通，了解其对伤残鉴定结果不认可的具体原因。这些原因可能包括鉴定机构资质问题、鉴定程序违法、鉴定时机不当或鉴定标准适用错误等。

2. 尝试协商解决：

   • 在了解原因后，您可以与保险公司进行充分协商，解释鉴定过程的合法性、科学性及公正性，并提供相关证据（如鉴定机构的资质证明、伤者的详细病历资料等）以消除保险公司的疑虑。

3. 依法申请重新鉴定：

   • 若协商无果，保险公司坚持要求重新鉴定，您可以在符合法律规定的情况下同意重新鉴定。双方应协商选择一家具备资质的鉴定机构进行重新鉴定；若协商不成，可由人民法院指定鉴定机构。

4. 法院指定鉴定的效力：

   • 如果最终由法院指定了鉴定机构进行鉴定，那么该鉴定结果在法律上具有较高的权威性和公信力。在诉讼过程中，法院会根据相关法律法规和证据规则，对鉴定结果进行审查和判断。一旦法院采纳了该鉴定结果，并据此作出判决，那么该鉴定结果就是最终的，对双方都具有法律约束力。

5. 保留并整理相关证据：

   • 在处理此类争议时，您应特别注意保留和整理所有相关证据，包括交通事故认定书、医疗记录、初次及重新鉴定的报告、与保险公司沟通的记录等。这些证据将有助于证明您的伤残情况和鉴定意见的合理性，为后续的协商、重新鉴定或法律诉讼提供有力支持。

6. 寻求专业律师帮助：

   • 在整个处理过程中，您可以咨询专业律师的意见。律师能够依据法律规定和案件具体情况，为您提供专业的法律意见和策略建议，帮助您更好地理解法律程序、准备证据材料以及应对可能的法律诉讼。

综上所述，当交通事故伤残鉴定自己鉴定后保险公司不认可时，您可以通过明确不认可原因、尝试协商解决、依法申请重新鉴定（包括法院指定鉴定）等步骤来维护自己的合法权益。其中，法院指定鉴定结果在法律上具有较高的权威性和公信力，一旦被法院采纳并据此作出判决，就是最终的。