结论前置：合同中约定了仲裁条款的情况下，一般不能直接向法院起诉，但存在仲裁协议无效等特殊情形时除外。

一、仲裁协议的法律效力

根据《中华人民共和国仲裁法》第五条的规定：“当事人达成仲裁协议，一方向人民法院起诉的，人民法院不予受理，但仲裁协议无效的除外。”这一条款确立了仲裁协议排除司法管辖的基本原则。也就是说，如果合同中存在有效的仲裁条款，那么当事人在发生纠纷时，应当首先通过仲裁方式解决，而不能直接向法院提起诉讼。

二、仲裁协议无效的情形

尽管仲裁协议具有排除法院管辖权的法律效力，但在某些特殊情况下，仲裁协议可能被认定无效，此时当事人可以向法院提起诉讼。根据《中华人民共和国仲裁法》第十七条的规定，以下情形导致仲裁协议无效：

1. 约定事项超出法定仲裁范围：如婚姻、收养等身份关系纠纷，这些纠纷不属于仲裁的受理范围。
2. 无民事行为能力人或限制行为能力人订立：如果仲裁协议是由无民事行为能力人或限制行为能力人订立的，那么该协议无效。
3. 一方采取胁迫手段迫使对方签订：如果仲裁协议是在一方采取胁迫手段的情况下订立的，那么该协议也无效。
4. 内容违反法律强制性规定：如果仲裁协议的内容违反了法律的强制性规定，那么该协议同样无效。

三、仲裁条款约定不明的情况

如果合同中的仲裁条款约定不明，比如未明确约定仲裁机构，或者约定的仲裁机构名称不准确、无法确定具体的仲裁机构，或者约定了由某地的仲裁机构仲裁但该地有多个仲裁机构的，根据《中华人民共和国仲裁法》第十八条的规定：“仲裁协议对仲裁事项或者仲裁委员会没有约定或者约定不明确的，当事人可以补充协议；达不成补充协议的，仲裁协议无效。”在这种情况下，如果当事人无法就仲裁事项或仲裁委员会达成补充协议，那么仲裁协议无效，当事人可以直接向有管辖权的人民法院提起诉讼。

四、实务操作建议

1. 审查仲裁协议有效性：在签订合同时，务必确保仲裁协议的有效性，明确约定仲裁机构和仲裁事项，以避免后续纠纷解决过程中的不必要的麻烦和损失。
2. 遵守程序要求：如果合同中存在有效的仲裁条款，那么当事人在发生纠纷时，应当及时向选定的仲裁委员会提交申请，遵守仲裁程序的要求。
3. 关注时效问题：无论是仲裁还是诉讼，都存在时效问题。一般来说，仲裁时效通常为两年（具体依合同约定或法律规定），逾期可能丧失胜诉权。因此，当事人在发生纠纷后，应当及时采取行动，以免错过时效。

五、典型案例说明

• 案例1：甲公司与乙公司签订买卖合同并约定仲裁条款。发生纠纷后甲公司直接起诉，法院以存在有效仲裁协议为由裁定不予受理。
• 案例2：丙与丁的借款合同中仲裁条款因未明确仲裁机构被认定无效，双方可直接向法院起诉。

总结与建议：合同中的仲裁条款或仲裁协议具有排除法院管辖权的法律效力。在签订合同时，双方应当充分考虑纠纷解决方式的选择，并明确约定仲裁条款或签订仲裁协议。如果在实际操作中遇到任何问题或疑问，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供准确的法律意见和帮助。