分包协议只盖公司章而法人未签字，该协议在一般情况下是有效的。以下从不同角度为你详细分析：
法律背景与规定
根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，当事人采用合同书形式订立合同的，自当事人均签名、盖章或者按指印时合同成立。在签名、盖章或者按指印之前，当事人一方已经履行主要义务，对方接受时，该合同也成立。这意味着，合同的成立并不完全依赖于法定代表人的签字，只要合同上有公司的公章，且该公章是真实有效的，通常就视为公司对合同内容的认可。
具体情形分析
公章的真实性与有效性：
- 如果分包协议上的公司公章是真实且有效的，那么即使法人没有签字，该协议仍然具有法律效力。因为公章代表了公司的意志，是公司对外进行法律行为的重要标识。
法人签字的作用：
- 法人签字在合同中通常起到确认合同内容、表明法人个人对合同认可的作用。然而，在公章真实有效的情况下，法人签字并非合同成立的必要条件。当然，如果法人签字与公章同时存在，可以进一步增强合同的证明力和可信度。
特殊情况下的无效情形：
- 如果分包协议存在违反法律、行政法规的强制性规定，或者违背公序良俗等情形，那么该协议可能被视为无效。此外，如果公章是伪造或盗用的，那么使用该公章签订的合同也可能被视为无效。
法律建议
确保公章的真实性与有效性：
- 在签订分包协议时，务必确保所使用的公司公章是真实且有效的。可以通过查询公司公章的备案信息、与公司相关人员核实等方式来确认公章的真实性。
考虑法人签字作为补充：
- 尽管法人签字并非合同成立的必要条件，但为了增强合同的证明力和可信度，可以考虑要求法人签字作为补充。这可以在一定程度上减少因公章问题而引发的纠纷。
注意合同内容的合法性与合规性：
- 在签订分包协议时，务必确保合同内容符合法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗。否则，即使合同上有公司公章和法人签字，也可能被视为无效。
及时咨询专业律师：
- 如果你对分包协议的法律效力存在疑问，或者担心可能存在的法律风险，建议及时咨询专业律师。我可以为你提供专业的法律意见和帮助，确保你的合法权益得到保障。
综上所述，分包协议只盖公司章而法人未签字，在一般情况下是有效的。但为了确保合同的合法性和有效性，建议你注意上述法律建议，并在必要时咨询专业律师。如果你有任何法律问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。