若对监委查证的企业违法所得金额有异议，且企业本身并未涉及犯罪，可通过以下途径依法维权：

1. 申请复核或提出书面异议
   根据《中华人民共和国监察法实施条例》及相关规定，监察机关在调查过程中应保障被调查对象的合法权益。若企业对违法所得金额的认定存在异议，可在收到监委的初步调查结论后，及时以书面形式提出复核申请或异议说明，要求监委重新审查相关证据（如财务账目、合同、资金流向等），并补充说明金额计算的依据和合理性。
   关键点：异议需基于事实和法律依据，避免情绪化表述；需明确指出监委认定金额与实际不符的具体环节（如收入漏计、成本多扣等）。

2. 申请听证或陈述申辩
   若监委拟对企业作出最终处理决定（如没收违法所得），企业有权要求监委组织听证会，或直接向监委提交书面陈述申辩材料。听证会中，企业可委托律师或财务专家参与，通过质证、辩论等方式反驳不实认定。
   法律依据：《监察法》第四十六条规定，监察机关经调查认为违法事实清楚、证据确实充分的，应形成调查报告，并听取被调查人陈述申辩意见。

3. 申请行政复议或提起行政诉讼（若涉及行政处罚）
   若监委将案件移送行政机关（如市场监管局、税务局）作出行政处罚（如罚款、没收违法所得），企业可在收到处罚决定书后60日内申请行政复议，或6个月内直接提起行政诉讼，要求法院审查违法所得金额的合法性。
   注意：需区分监察程序与行政程序。若监委仅调查未移送行政机关，则需通过前述复核、听证途径解决；若已移送，则可同步启动行政救济。

4. 申请检察机关监督
   若企业认为监委在调查过程中存在程序违法（如超期查封账户、未依法调取证据等），可向同级人民检察院申请立案监督，要求检察院对监委的调查行为进行合法性审查。
   适用情形：仅针对程序违法，不直接涉及金额认定实体问题。

操作建议：

• 证据固定：立即整理企业财务凭证、合同、银行流水等关键证据，形成完整的反驳材料；
  
• 专业协助：委托律师或财务审计机构协助分析监委认定金额的漏洞，并制定维权策略；
  
• 时效把控：严格注意复核、听证、复议、诉讼的期限，避免因超期丧失权利。
  

若企业未涉及犯罪，监委的调查应严格限定于违法所得的核实，不得扩大至刑事追责。如有进一步疑问，可直接向我咨询具体操作细节。