书记员因工作失误造成案情损失，需根据具体情况承担相应责任，具体处理方式如下：

1. 内部追责与纪律处分
   若书记员的失误属于工作疏忽（如记录错误、文件遗失等），但未造成严重后果或未触犯法律，通常由法院内部进行追责。根据《人民法院工作人员处分条例》，可能给予警告、记过、记大过等纪律处分，并要求其承担部分或全部经济损失（如补救费用、赔偿当事人损失等）。

2. 民事赔偿责任
   若失误导致当事人直接经济损失（如延误诉讼时效、证据灭失导致败诉等），当事人可依据《民法典》第1165条（过错责任原则）向法院或书记员个人主张民事赔偿。但实践中，法院作为用人单位可能承担主要赔偿责任，书记员个人是否需赔偿需结合其过错程度、收入情况等综合判断。

3. 刑事责任风险
   若失误涉及故意或重大过失（如伪造证据、泄露国家秘密等），可能触犯《刑法》第397条（滥用职权罪/玩忽职守罪）或第307条（帮助毁灭、伪造证据罪）。例如，故意篡改庭审记录导致错判，可能被追究刑事责任，但单纯的工作疏忽一般不构成犯罪。

4. 救济与补救措施

   • 当事人角度：可向法院申请复议、申诉或提起国家赔偿（若符合《国家赔偿法》第38条情形）；
     
   • 法院角度：应启动内部调查，及时纠正错误（如补正笔录、重新开庭等），并主动与当事人沟通协商赔偿事宜；
     
   • 书记员角度：需配合调查，积极补救（如协助找回文件、出庭说明情况等），以减轻责任。

建议：若您是当事人，建议先通过书面形式向法院反映问题，要求书面答复并留存证据；若您是书记员，建议立即向上级报告失误，主动采取补救措施，并咨询律师评估法律风险。具体处理需结合失误性质、损失后果等细节，如有疑问可进一步向我咨询。