在建设工程约定的结算期结束后，通常有以下几种处理方式，具体需结合合同约定和实际情况来分析：

1. 双方协商一致，完成最终结算
   如果双方在结算期内已经完成了大部分结算工作，仅剩少量争议或未决事项，可以在结算期结束后继续协商，达成一致后签署最终结算协议。这种方式成本较低，效率较高，是较为理想的解决途径。
   建议：在协商过程中，注意保留书面沟通记录（如邮件、微信等），避免口头约定，以防止后续争议。

2. 依据合同约定，启动争议解决程序
   如果双方在结算期内未能达成一致，且合同中明确约定了争议解决方式（如仲裁或诉讼），则任何一方均可依据合同约定启动相应程序。

   • 仲裁：如果合同约定了仲裁条款，需向约定的仲裁机构提交仲裁申请。仲裁具有一裁终局的特点，效率较高，但需注意仲裁条款的合法性和有效性。
     
   • 诉讼：如果合同未约定仲裁或仲裁条款无效，任何一方均可向法院提起诉讼。诉讼程序相对复杂，耗时较长，但具有强制执行力。
     建议：在启动争议解决程序前，建议先梳理相关证据（如合同、结算文件、沟通记录等），并咨询专业律师，制定合理的诉讼或仲裁策略。

3. 依据法律规定，主张权利
   如果合同未明确约定结算期结束后的处理方式，或约定不明确，可依据《中华人民共和国民法典》等相关法律规定主张权利。

   • 发包人未支付工程款：承包人可依据《民法典》第八百零七条的规定，主张优先受偿权，即在工程价款范围内对工程折价或拍卖的价款优先受偿。
     
   • 承包人未提交结算文件：发包人可依据《民法典》及相关司法解释的规定，要求承包人提交结算文件或自行委托第三方进行结算。
     建议：在主张权利时，需注意诉讼时效问题（通常为三年），避免因超过时效而丧失胜诉权。

4. 通过第三方机构协助结算
   如果双方对结算金额存在争议，且协商无果，可共同委托第三方机构（如造价咨询公司）进行结算审核。第三方机构的审核结果通常具有较高的公信力，可作为双方结算的依据。
   建议：在选择第三方机构时，需注意其资质和信誉，并在委托协议中明确审核范围、期限及费用承担等事项。

总结：建设工程结算期结束后的处理方式需结合合同约定和实际情况选择。建议双方优先通过协商解决争议，若协商无果，可依据合同约定或法律规定启动争议解决程序，或委托第三方机构协助结算。如有具体问题，欢迎随时向我咨询。