联合体协议在后期是可以更改内容的，但需要满足一定的条件并遵循法定程序。具体分析如下：

1. 协议变更的合法性基础
   根据《中华人民共和国民法典》第五百四十三条，当事人协商一致可以变更合同。联合体协议作为民事合同的一种，其内容变更需以全体成员协商一致为前提。若协议中已约定变更程序（如需特定比例成员同意），则应优先适用约定条款。

2. 变更的实质要件

   • 全体成员同意：原则上需所有联合体成员签署书面变更协议，明确修改条款及生效时间。
     
   • 不违反强制性规定：变更内容不得违反法律、行政法规的效力性强制性规定（如招投标法中关于联合体资质的强制性要求）。
     
   • 不损害第三方利益：若变更涉及第三方权益（如发包方、债权人），需取得第三方书面同意，否则可能面临合同无效风险。

3. 变更的程序要求

   • 书面形式：根据《民法典》第四百六十九条，合同变更应采用书面形式，口头变更在无其他证据佐证时难以被法院采信。
     
   • 备案或通知义务：若原协议已向行政机关备案（如建设工程联合体需向建设主管部门备案），变更后需及时办理备案更新手续。
     
   • 公告或通知：涉及公共利益的项目（如政府采购联合体），可能需通过指定渠道公告变更内容。

4. 特殊情形下的变更限制

   • 招投标项目：根据《招标投标法》第三十一条，联合体资质、分工等核心条款在投标后原则上不得变更，否则可能被认定为串通投标或规避招标。
     
   • 政府采购项目：若联合体已中标，变更成员或分工需重新获得采购人同意，否则采购人有权解除合同并追究违约责任。
     
   • 诉讼/仲裁中的变更：若联合体协议涉及争议解决条款（如管辖法院、仲裁机构），变更需经全体成员同意且不得损害已启动程序的效力。

实务建议：

1. 变更前应全面审查原协议条款，重点评估变更对资质、责任划分、利益分配的影响；
   
2. 保留变更协商过程的书面证据（如会议纪要、邮件往来），避免因举证不能承担不利后果；
   
3. 若涉及重大变更（如更换核心成员、调整出资比例），建议委托律师起草变更协议并见证签署过程。
   

如需进一步分析具体协议条款或变更方案，可提供协议文本及变更背景，我将结合行业惯例和司法实践为您制定合规方案。