在办理法人变更时，股东名册上应由新法人签字，而非旧法人。以下是对这一问题的详细解释：

一、法人变更的法律意义

法人变更，指的是公司法定代表人的更换。法定代表人作为公司的法律代表，其变更意味着公司对外法律关系的主体发生了变化。因此，这一变更需要在公司内部和外部进行相应的登记和公告，以确保交易的安全和法律的明确性。

二、股东名册的作用与变更

股东名册是公司记录股东信息的重要文件，它反映了公司的股权结构和股东身份。在法人变更的情况下，虽然股东本身可能并未发生变化，但法定代表人的变更仍然需要在股东名册上进行相应的记载和更新。这是因为，股东名册不仅记录了股东的信息，还体现了公司治理结构的一部分，法定代表人的变更自然应当在其中得到体现。

三、新法人签字的必要性

1. 法律效力的体现：新法人作为公司的法律代表，其签字具有法律效力。在股东名册上由新法人签字，可以确保该名册的合法性和有效性，从而保障公司、股东以及第三方的权益。

2. 公司治理的连续性：法人变更后，公司需要保持治理的连续性和稳定性。新法人在股东名册上签字，是公司治理结构调整的一部分，有助于确保公司运营的顺畅进行。

3. 避免法律纠纷：如果由旧法人继续在股东名册上签字，可能会引发法律纠纷和不确定性。因为旧法人已经不再是公司的法律代表，其签字可能无法得到法律的认可和保护。

四、实际操作中的注意事项

1. 及时更新股东名册：在法人变更后，公司应及时更新股东名册，确保新法人的信息得到准确记载。

2. 办理相关登记手续：除了更新股东名册外，公司还需要按照相关法律法规的规定，办理法人变更的登记手续，如向工商行政管理部门提交变更申请等。

3. 保留相关证据：在办理法人变更和更新股东名册的过程中，公司应保留好相关证据和文件，以备不时之需。

建议：在办理法人变更时，公司应严格按照相关法律法规的规定进行操作，确保新法人在股东名册上签字，并及时办理相关登记手续。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供专业的法律意见。