关于工厂是否有权对员工在工厂内抽烟进行罚款的问题，这并非一个简单的“是”或“否”的答案，而是需要综合考虑多个因素。
首先，从法律层面来看，工厂作为非行政机关，并不具备直接的行政处罚权。这意味着，从严格的法律意义上讲，工厂直接对员工处以罚款（作为行政处罚）是不合法的。然而，这并不意味着工厂在员工违规抽烟时完全无计可施。
关键在于工厂是否有合法有效的规章制度来规范员工的行为。这些规章制度应当经过合法的制定和公示程序，比如经过职工代表大会或全体职工讨论，并与工会或职工代表平等协商确定，且需进行公示或告知劳动者。如果工厂有这样的规章制度，并且明确规定了在特定区域（如易燃易爆生产车间）禁止抽烟，以及违反规定的相应处理措施（如扣除绩效奖金等，而非直接罚款），那么这些规定在员工已知晓并同意的情况下，通常是合法的。
接下来，我们考虑罚款的合理性与适当性。即使工厂有规章制度支持对违规抽烟的员工进行处理，罚款金额也必须合理且适当。罚款应当与员工的过错程度及企业的实际损失相适应。如果罚款过重、不合理，或未事先与员工约定，那么这种罚款行为可能构成不合法。
那么，作为员工，如果你在工厂内抽烟并面临罚款，你应该怎么做呢？
了解工厂规定：首先，你需要了解工厂是否有关于抽烟的明确规定，以及这些规定是否经过了合法的制定和公示程序。
沟通与协商：如果你认为罚款不合理或工厂的规定存在问题，你可以先与工厂相关负责人进行沟通，表达你的看法，并尝试通过协商解决争议。
寻求帮助：如果协商无果，你可以向工厂工会寻求帮助，由工会进行调解或提供法律援助。
法律途径：若调解不成，你还可以向劳动监察部门投诉，由其对工厂的罚款行为进行审查和处理。同时，你也可以收集相关证据（如规章制度文本、罚款通知、工资条等），通过劳动仲裁或诉讼的方式来维护自己的合法权益。
综上所述，工厂对员工抽烟行为进行罚款的合法性并非绝对，而是取决于工厂的规章制度是否合法有效、罚款金额是否合理适当以及是否遵循了相关法律程序。作为员工，在面对此类情况时，应了解自己的权益，并通过适当的途径来维护自己的合法权益。