结论前置：协议没有签名但有指纹，其效力不能一概而论，关键在于指纹能否被认定为等同于签名以及协议是否满足其他生效条件。在多数情况下，仅有指纹可能不足以使协议生效，但具体还需结合协议内容、相关法律规定及司法实践来判断。
一、指纹与签名的法律效力对比
签名：
- 签名是当事人对协议内容认可和同意的一种明确且常见的书面确认方式，具有直接的法律效力。
- 签名能够清晰地表明当事人的身份和意愿，是协议生效的重要要素之一。
指纹：
- 指纹虽然也能在一定程度上确认当事人的身份，但其法律效力和明确性通常不如签名。
- 在没有明确约定或法律规定的情况下，指纹本身可能不足以单独作为协议生效的依据。
二、协议生效的关键条件
协议要生效，除了需要当事人有明确的确认方式（如签名）外，还需满足以下条件：
民事行为能力：
- 协议双方均需具备相应的民事行为能力，能够理解并承担协议所设定的权利与义务。
真实意思表示：
- 协议内容必须是双方真实、自愿的意思表示，未受欺诈、胁迫等不正当因素影响。
合法性：
- 协议内容不得违反法律、行政法规的强制性规定，也不得违背公序良俗。
三、仅有指纹的协议效力分析
一般情况：
- 在没有明确约定或法律规定的情况下，仅有指纹的协议可能因缺乏明确的当事人确认方式而难以被认定为生效。
- 指纹虽然能提供一定的身份确认，但无法像签名那样直接表明当事人的意愿和认可。
特殊情况：
- 如果协议中明确约定指纹具有与签名同等的法律效力，或者相关法律法规规定指纹可以作为协议生效的依据，那么仅有指纹的协议也可能被认定为有效。
- 在某些特殊情况下，如当事人因身体原因无法签名，但通过其他方式（如按指纹）表达了真实意愿，且该意愿得到了其他证据的佐证，协议也可能被认定为有效。
四、司法实践中的判断标准
在司法实践中，法院会综合考虑各种因素来判断仅有指纹的协议的效力，包括但不限于：
- 指纹的真实性和合法性；
- 协议内容的合法性与合理性；
- 当事人之间的交易习惯、行业惯例等；
- 其他相关证据和证人证言等。
五、建议与注意事项
明确约定：
- 在签署协议时，最好明确约定确认方式（如签名、盖章或按指纹），并明确各种方式的法律效力。
完善证据：
- 如果仅使用指纹作为确认方式，建议同时收集其他证据（如录音、录像、证人证言等）来佐证当事人的真实意愿和协议内容。
咨询专业律师：
- 在签署涉及重要权益的协议时，建议咨询专业律师以确保协议的合法性和有效性。不过，既然你已经在向我咨询，我会尽我所能为你提供专业的法律建议。
示例说明：假设甲和乙签订了一份买卖合同，但甲仅在合同上按了指纹而没有签名。如果合同中没有明确约定指纹具有与签名同等的法律效力，且没有其他证据佐证甲的真实意愿和合同内容，那么这份合同可能因缺乏明确的当事人确认方式而难以被认定为生效。但如果甲能提供其他证据（如录音、录像等）来证明其确实有签订合同的意愿，并且合同内容合法、合理，那么法院可能会综合考虑各种因素后认定合同有效。
综上所述，协议没有签名但有指纹的效力不能一概而论，具体还需结合协议内容、相关法律规定及司法实践来判断。如果你有具体的协议或情况需要咨询，请直接向我提问，我会为你提供更详细的法律建议。