协议书不是本人书写，但签名、按指纹是否有法律效力，需分情况讨论：

1. 有本人授权的情况：

   • 若协议书上的签名、指纹是经本人明确授权他人代为进行的，且代签、代按指纹的行为在授权范围内，那么该协议书对本人具有法律效力。例如，本人出具了明确的授权书，允许他人代为签订合同并签名、按指纹。

2. 无本人授权但事后追认的情况：

   • 若协议书上的签名、指纹未经本人授权，但本人事后对协议内容进行了追认，那么该协议书同样对本人具有法律效力。追认可以通过书面形式、口头形式或实际履行协议主要义务等方式进行。

3. 构成表见代理的情况：

   • 在某些特殊情况下，即使协议书上的签名、指纹不是本人所为，但相对人有理由相信行为人有代理权的，该代理行为有效，协议书对本人具有约束力。这通常发生在行为人长期以本人名义对外签约，且相对人对此有合理信赖的情况下。

4. 本人实际履行主要义务且对方接受的情况：

   • 即使协议书上的签名、指纹不是本人所为，但如果本人以实际行动履行了协议的主要义务，且对方接受了这种履行，那么可以视为本人对协议的认可，协议书对本人具有法律效力。

5. 协议内容违法或违背公序良俗的情况：

   • 无论协议书上的签名、指纹是否为本人所为，如果协议内容违反了法律、行政法规的强制性规定，或者违背了公序良俗，那么该协议书自始无效，对本人不具有法律效力。

法律建议：

• 在签订协议书时，应确保签名、指纹为本人所为，或经过本人明确授权。
• 若发现协议书上的签名、指纹非本人所为，应及时与对方沟通，了解情况并寻求解决方案。
• 若认为协议书对自己不具有法律效力，或存在其他法律纠纷，建议及时咨询专业律师，以便更好地维护自己的合法权益。

总结：协议书不是本人书写，但签名、按指纹是否有法律效力，需根据具体情况进行判断。不能一概而论地认为此类协议书无效或有效，而应结合授权情况、追认情况、表见代理情况、实际履行情况以及协议内容是否合法等因素进行综合考量。如有任何法律疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。