在探讨代为管理的门店中员工的劳动关系归属问题时，我们首先要明确劳动关系的核心特征。根据相关法律法规及司法实践，劳动关系通常具备以下几个关键要素：用人单位和劳动者符合法律、法规规定的主体资格；劳动者接受用人单位的劳动管理，从事用人单位安排的有报酬的劳动；劳动者提供的劳动是用人单位业务的组成部分。
现在，针对代为管理的门店这一特定情境，我们需要分析门店的实际管理情况以及员工与哪一方存在实质上的劳动管理关系。
如果代为管理方直接对员工进行劳动管理：
- 这意味着员工接受代为管理方的指令、监督，并按照其安排进行工作。
- 员工的劳动报酬由代为管理方支付，且其工作是代为管理方业务的一部分。
- 在这种情况下，尽管门店可能由另一方所有或委托管理，但员工的劳动关系实际上是与代为管理方建立的。
如果门店所有方直接对员工进行劳动管理：
- 员工直接接受门店所有方的指令、监督，并按照其安排进行工作。
- 员工的劳动报酬由门店所有方支付，且其工作是门店所有方业务的一部分。
- 在这种情况下，员工的劳动关系是与门店所有方建立的，代为管理方仅作为管理服务的提供者，并不直接涉及劳动关系的建立。
特殊情况：存在三方协议或复杂管理结构：
- 在某些情况下，可能存在门店所有方、代为管理方和员工之间的三方协议，明确规定了各方的权利和义务。
- 或者，门店的管理结构可能较为复杂，涉及多层级的委托管理关系。
- 在这种情况下，需要仔细审查协议内容和管理结构，以确定员工的实际劳动关系归属。通常，这需要根据具体协议条款、管理实践以及相关法律法规进行综合判断。
综合判断与建议：
- 在没有具体协议或管理结构信息的情况下，我们无法直接确定员工的劳动关系归属。
- 为了明确这一点，建议审查门店的管理协议、员工合同以及实际管理实践。
- 如果存在争议或不明确之处，建议咨询专业法律人士或劳动仲裁机构，以获取针对具体情况的准确法律意见。
总之，代为管理的门店中员工的劳动关系归属取决于实际的管理情况、协议条款以及相关法律法规的规定。在缺乏具体信息的情况下，无法给出绝对的答案，但通过上述分析，我们可以为判断这一问题提供清晰的框架和思路。