结论：签独家卖房时，中介拿走房产证一般是不合法的，除非有您的明确授权或符合特定法定情形。

分析说明：

1. 房产证的重要性：

   • 房产证是房屋所有权的法律凭证，它证明了房屋的所有权归属。对于房主而言，房产证是极其重要的个人财产证明文件，应当妥善保管。

2. 中介拿走房产证的合法性：

   • 在一般情况下，中介机构无权拿走房主的房产证。房产证作为房主的重要财产证明，其保管责任应由房主自行承担。
   • 如果中介机构需要查看房产证以核实房屋信息或进行相关手续，房主可以在场的情况下提供复印件或展示原件，但不应将原件交给中介机构保管。
   • 唯一例外的情况是，如果房主与中介机构签订了书面协议，明确授权中介机构在特定期间内保管房产证，并且该协议符合相关法律法规的规定，那么中介机构拿走房产证可能是合法的。但这种情况较为罕见，且需要房主的高度谨慎和明确授权。

3. 独家卖房协议与房产证保管：

   • 独家卖房协议是房主与中介机构之间就房屋独家销售事宜达成的协议。该协议主要规定的是双方的权利和义务，如销售期限、佣金比例等。
   • 除非独家卖房协议中明确约定了房产证的保管事宜，并且该约定符合相关法律法规的规定，否则中介机构无权根据独家卖房协议拿走房产证。

4. 法律后果与风险提示：

   • 如果中介机构未经房主同意擅自拿走房产证，可能构成侵权行为，房主有权要求中介机构返还房产证并承担相应的法律责任。
   • 房主在签订独家卖房协议时，应仔细阅读协议条款，特别是关于房产证保管的约定。如果协议中有不明确或不利于房主的条款，房主应及时提出修改或拒绝签订。

行动建议：

• 谨慎保管房产证：作为房主，您应谨慎保管自己的房产证，避免将原件交给任何未经授权的机构或个人。
• 明确协议条款：在签订独家卖房协议时，务必明确协议中关于房产证保管的条款，确保自己的权益不受侵害。
• 及时维权：如果发现中介机构擅自拿走房产证或存在其他违法行为，您应及时向相关部门投诉或寻求法律帮助，以维护自己的合法权益。

如果您在房产交易过程中遇到任何法律问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。