针对您提出的“非法经营罪扣押的香烟怎么处理”这一问题，我将结合相关法律法规和实际处理流程，为您进行详细解答。

一、扣押香烟的性质与目的

在非法经营罪案件中，扣押的香烟属于涉案物品，其扣押的目的主要是为了固定证据、防止证据灭失，以及确保后续法律程序的顺利进行。这些香烟将作为证明犯罪嫌疑人非法经营行为的重要物证。

二、扣押香烟的处理流程

1. 侦查阶段：

   • 公安机关在侦查过程中，若发现犯罪嫌疑人非法经营的香烟，会依法进行扣押，并制作扣押清单，由犯罪嫌疑人签字确认。
   • 扣押的香烟将被妥善保管，防止损坏或灭失，同时作为后续审查起诉和审判阶段的证据使用。

2. 审查起诉阶段：

   • 检察院在审查起诉时，会对扣押的香烟进行核实，确认其与案件事实的关联性。
   • 若香烟确属非法经营所得，且犯罪事实清楚、证据确实充分，检察院将依法提起公诉，并将扣押的香烟作为证据移送法院。

3. 审判阶段：

   • 法院在审理案件时，会对扣押的香烟进行审查，确认其作为证据的合法性和有效性。
   • 若法院最终认定犯罪嫌疑人构成非法经营罪，扣押的香烟将作为赃物予以没收，上缴国库或按照相关规定处理。

三、扣押香烟处理的相关法律依据

• 《中华人民共和国刑法》第二百二十五条：明确规定了非法经营罪的构成要件和刑罚，为扣押香烟的处理提供了法律基础。
• 《关于办理非法生产、销售烟草专卖品等刑事案件具体应用法律若干问题的解释》：详细规定了非法经营烟草专卖品的量刑标准和证据要求，为扣押香烟的处理提供了具体指导。

四、特殊情况下的处理

• 若扣押的香烟存在变质、损坏等无法继续保存的情况，公安机关或检察院会依法进行拍照、录像等证据固定工作，并按照相关规定处理实物。
• 若犯罪嫌疑人在案件审理过程中主动退缴违法所得，包括非法经营的香烟，法院在量刑时会予以考虑，并可能根据具体情况减轻或免除处罚。

五、建议与提醒

• 对于涉嫌非法经营香烟的行为人，建议及时咨询专业律师或法律机构，了解自身权利和义务，积极配合调查和处理工作。
• 非法经营香烟不仅可能面临严厉的刑事处罚，还会对个人声誉和家庭造成不可挽回的损失。因此，请务必遵守国家法律法规，不要从事任何形式的非法经营活动。

综上所述，非法经营罪扣押的香烟将作为涉案物品，在侦查、审查起诉和审判阶段作为证据使用，并最终根据法院判决结果进行没收或处理。希望以上解答能够对您有所帮助。