部委与地方签订的协议，在符合法律规定且不违反强制性规定的情况下，通常是有效的。以下从不同角度为你详细分析：
一、协议有效的法律基础
合同自由原则：根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，民事主体有权依照自己的意愿设立、变更、终止民事法律关系。部委与地方作为民事主体（在特定法律关系中，如合作协议等，可视为平等的民事主体），有权签订协议，只要协议内容不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗，即具有法律效力。
行政协议的特殊性：如果部委与地方签订的协议涉及行政管理职能，如政府采购、特许经营等，这类协议可能属于行政协议范畴。行政协议虽然具有行政性，但同样需要遵循合法、自愿、公平等原则。只要行政协议的内容合法、程序正当，且不违反法律法规的强制性规定，也是有效的。
二、协议可能无效的情形
违反法律、行政法规的强制性规定：如果协议内容违反了法律、行政法规的强制性规定，如违反了国家关于土地管理、环境保护、税收等方面的法律法规，那么该协议可能被认定为无效。
违背公序良俗：公序良俗是民事法律行为的基本原则之一。如果协议内容违背了社会公德、公共利益或善良风俗，如涉及赌博、色情等违法活动，那么该协议同样可能被认定为无效。
恶意串通损害他人利益：如果部委与地方在签订协议时存在恶意串通，损害国家、集体或第三人利益的情况，那么该协议也可能被认定为无效。
三、实际案例与法律建议
实际案例：在实际操作中，部委与地方签订的协议多涉及基础设施建设、公共服务提供等领域。这些协议在签订时通常会经过严格的法律审查和程序合规性检查，以确保其合法性和有效性。然而，也有个别案例因协议内容违法或程序不当而被认定为无效。
法律建议：
四、后续行动建议
如果你或你所在的机构正面临部委与地方签订协议的相关问题，或者对协议的效力存在疑问，可以直接向我咨询。我可以根据具体情况为你提供详细的法律分析和建议，帮助你更好地理解和处理相关问题。