结论：秘书若没有违法，一般情况下不会被留置。但具体是否会被留置，还需结合实际情况和留置的法定条件来判断。

分析：

1. 留置的法定条件：

   • 留置是监察机关在调查涉嫌贪污贿赂、失职渎职等严重职务违法或者职务犯罪时，对已经掌握部分违法犯罪事实及证据，但仍有重要问题需要进一步调查，且具备法定情形（如可能逃跑、自杀，可能串供或者伪造、隐匿、毁灭证据等）的被调查人采取的措施。
   • 留置的对象主要是涉嫌严重职务违法或职务犯罪的公职人员，以及相关涉案人员。

2. 秘书的角色与留置的关系：

   • 秘书作为公司领导的工作助手，通常不直接参与公司的核心决策或财务管理等关键环节，除非有证据表明其涉及违法犯罪行为。
   • 若秘书没有违法，且没有证据表明其与领导的违法犯罪行为有关联，那么秘书就不符合留置的法定条件。

3. 实际情况的考量：

   • 在实际操作中，监察机关会严格依法办事，不会随意对无关人员进行留置。
   • 如果秘书确实没有违法，且没有证据表明其与案件有关，那么即使领导被查，秘书也不应被留置。
   • 但如果秘书在不知情的情况下被利用，或者存在其他复杂情况，如与领导有共同的经济往来等，可能需要进一步调查以确定其是否涉及违法犯罪。

4. 法律建议：

   • 如果秘书担心自己可能因领导被查而受到影响，可以主动向监察机关说明情况，提供相关证据证明自己的清白。
   • 同时，秘书也可以咨询专业律师，了解自己的法律权益和可能的法律风险，以便更好地应对可能出现的法律问题。

后续行动建议：

• 如果秘书确实没有违法，且没有与领导的违法犯罪行为有关联，那么可以保持冷静，配合监察机关的调查工作，同时积极收集证据证明自己的清白。
• 如果秘书担心自己的权益受到侵害，或者对留置等法律措施有疑问，可以直接向我咨询，我会根据具体情况提供专业的法律建议和帮助。

总之，留置是一项严肃的法律措施，监察机关会严格依法办事。秘书若没有违法，一般情况下不会被留置。但如有任何疑问或担忧，建议及时咨询专业律师以获取更具体的法律指导。