结论：在协议约定孩子跟父亲生活但实际与母亲生活的情况下，抚养费的支付责任需根据实际情况和双方协商来确定，一般原则是谁实际抚养孩子，另一方应支付抚养费。若双方无法协商一致，则可能需通过法律途径解决。

详细分析：

1. 协议与实际抚养情况不符：

   • 双方原本协议约定孩子由父亲抚养，但实际上孩子一直与母亲生活。这种情况下，协议中的抚养条款并未得到实际履行。
   • 从法律角度来看，抚养协议是双方自愿达成的，具有法律约束力。但当实际情况与协议不符时，双方应重新协商或寻求法律途径解决。

2. 抚养费的支付原则：

   • 抚养费的主要目的是保障孩子的正常生活和成长。因此，无论协议如何约定，实际抚养孩子的一方有权要求另一方支付抚养费。
   • 在本案例中，由于孩子实际与母亲生活，母亲承担了主要的抚养责任。因此，父亲作为非直接抚养方，应支付相应的抚养费。

3. 双方协商与法律途径：

   • 双方应首先尝试通过协商来解决抚养费支付问题。协商时，可以考虑孩子的实际需要、双方的经济状况以及当地的生活水平等因素。
   • 如果协商不成，母亲可以向法院提起诉讼，要求父亲支付抚养费。法院会根据实际情况和法律规定来判决抚养费的数额和支付方式。

4. 可能的法律后果：

   • 如果父亲拒绝支付抚养费，母亲可以申请法院强制执行。法院有权采取多种措施来强制执行判决，如冻结银行账户、扣押财产等。
   • 同时，父亲拒绝支付抚养费的行为也可能对其信用记录产生负面影响，影响其未来的贷款、信用卡申请等。

建议：

• 双方应尽快就抚养费支付问题进行协商，以达成一致意见。协商时，应充分考虑孩子的实际需要和双方的经济状况。
• 如果协商不成，母亲应及时向法院提起诉讼，以维护自己和孩子的合法权益。在诉讼过程中，母亲应提供充分的证据来证明自己的抚养责任和父亲的经济状况。
• 无论通过协商还是法律途径解决，双方都应保持冷静和理性，以孩子的利益为重，避免因为抚养费问题而影响到孩子的成长和心理健康。

如有更多疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。