市级医院将道路交通事故救助基金作为医疗费收取是不合法的。以下是对这一问题的详细分析：
一、道路交通事故救助基金的性质与用途
道路交通事故救助基金，通常是由政府设立或指定机构管理，用于垫付交通事故中受害人人身伤亡的丧葬费用、部分或者全部抢救费用的社会救助基金。其核心目的是保障交通事故受害人在无法及时获得赔偿时，能够得到必要的医疗救治和丧葬处理，体现的是社会救助和公益性质。
二、医疗费收取的合法性与合规性
医疗费收取的依据：
- 医院在提供医疗服务后，有权根据服务内容和标准向患者收取医疗费。这一行为通常基于医疗服务合同，并受到相关法律法规的规范。
救助基金与医疗费的区别：
- 救助基金是用于垫付特定情况下的抢救费用或丧葬费用，其支付对象和条件有严格规定。它并非患者应支付的医疗费的一部分，而是由特定机构（如救助基金管理机构）根据规定进行垫付。
医院行为的违法性：
- 如果医院将救助基金作为医疗费收取，实际上是在未经授权的情况下，将本应由救助基金管理机构承担的费用转嫁给了患者。这种行为不仅违反了救助基金的使用规定，也损害了患者的合法权益。
三、可能的法律后果与维权途径
法律后果：
- 医院若违规收取救助基金作为医疗费，可能面临行政处罚，如罚款、责令改正等。同时，患者也有权要求医院退还多收的费用，并可能因此遭受的损失要求赔偿。
维权途径：
- 患者可以向当地卫生行政部门投诉，要求其对医院的违规行为进行调查和处理。
- 患者也可以咨询专业律师，通过法律途径维护自己的合法权益，如提起民事诉讼要求医院退还多收的费用并赔偿损失。
四、建议与提醒
患者应保留好相关证据：
- 如医疗费发票、救助基金垫付凭证等，以便在维权时提供有力支持。
及时咨询专业律师：
- 如果患者对医院的收费行为有疑问或认为自己的权益受到侵害，应及时咨询专业律师，了解自己的权利和维权途径。
关注救助基金的使用规定：
- 了解救助基金的申请条件、支付范围等，以便在需要时能够及时获得救助。
综上所述，市级医院将道路交通事故救助基金作为医疗费收取是不合法的。患者应了解自己的权利和维权途径，并在必要时寻求专业律师的帮助。如果你有进一步的法律问题或需要具体的法律建议，可以直接向我咨询。