房主有权且合法向包工包料的施工方索要发票。具体分析如下：

1. 从合同关系角度
   在自建房的包工包料合同中，房主与施工方形成的是承揽合同关系。根据《民法典》第七百七十条，承揽合同是承揽人按照定作人的要求完成工作，交付工作成果，定作人支付报酬的合同。施工方作为承揽人，有义务按照合同约定完成房屋建设并交付成果，而开具发票是施工方履行合同附随义务的一部分。即使合同未明确约定发票开具条款，根据《民法典》第五百零九条，当事人应当遵循诚信原则履行通知、协助等附随义务，因此房主索要发票具有合同依据。

2. 从税务法律角度
   根据《发票管理办法》第十九条，销售商品、提供服务或从事其他经营活动的单位和个人，对外发生经营业务收取款项时，应向付款方开具发票。施工方作为提供建筑服务的经营者，收取房主支付的工程款后，必须依法开具发票。若施工方拒绝开具，房主可向税务机关举报（《税收征收管理法》第十三条），税务机关将责令其改正并可能处以罚款。

3. 从房主权益保护角度
   发票是房主支付工程款的合法凭证，也是后续房屋质量维权、产权登记等环节的重要证据。若施工方未开具发票，房主可能面临以下风险：

   • 无法将工程款计入成本，影响企业或个人税务申报（如房主为企业主）；
     
   • 若发生纠纷，缺乏付款证明可能导致举证困难；
     
   • 施工方可能通过“不开票少缴税”降低报价，但后续若被税务稽查，房主可能被牵连补税。

操作建议：

1. 在签订合同时明确约定“施工方应在收到款项后X日内开具合法有效发票”，并约定违约责任（如按日支付违约金）；
   
2. 付款时通过银行转账留痕，避免现金支付；
   
3. 若施工方拒开发票，可先书面催告，仍不履行的向税务机关举报或通过诉讼主张权利。
   

如有其他细节需要进一步分析（如施工方为个人无开票资质、合同金额是否含税等），可直接向我咨询。