关于自建房邻居房受损协商修复是否合法的问题，结论是：协商修复本身是合法的，但具体合法性需结合实际情况和法律规定来判断。以下从多个角度为你详细分析：
协商修复的合法性基础：
- 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，不动产的相邻权利人应当按照有利生产、方便生活、团结互助、公平合理的原则，正确处理相邻关系。如果自建房的建设或使用过程中导致邻居房屋受损，双方有权通过协商来解决问题，包括修复受损房屋或赔偿损失等。
- 协商修复是民事纠纷解决的一种常见方式，它体现了当事人的意思自治原则，即双方有权在平等、自愿的基础上，通过协商达成一致意见来解决纠纷。
协商修复需注意的法律要点：
- 修复方案需合理：协商确定的修复方案应当合理、可行，能够确保受损房屋恢复到受损前的状态或达到相应的安全标准。如果修复方案不合理或无法实施，可能会导致协商失败或后续纠纷。
- 修复责任需明确：在协商过程中，应明确修复责任的分担方式。如果自建房的建设或使用是导致邻居房屋受损的直接原因，那么自建房的所有者或使用者通常应承担主要的修复责任。但如果邻居房屋本身存在老化、损坏等问题，或者受损是由于不可抗力等因素造成的，那么修复责任的分担可能需要根据具体情况进行协商。
- 协商结果需书面化：为了避免后续纠纷，建议将协商结果以书面形式记录下来，并由双方签字确认。这样可以在发生争议时提供有力的证据支持。
协商修复可能面临的法律后果：
- 如果协商成功：双方按照协商结果履行修复义务或支付赔偿款项后，纠纷得到解决，双方关系得以修复。
- 如果协商失败：双方无法就修复方案、修复责任或赔偿金额等达成一致意见，那么受损方有权向人民法院提起诉讼，要求自建房的所有者或使用者承担相应的法律责任。在诉讼过程中，法院将根据事实、证据和法律规定来判决修复责任的分担方式和赔偿金额等。
特殊情况下的考虑：
- 如果自建房属于违法建筑：如果自建房本身属于违法建筑，且其建设或使用导致了邻居房屋受损，那么除了协商修复或赔偿损失外，自建房的所有者或使用者还可能面临行政处罚等法律后果。在这种情况下，协商修复的合法性可能会受到一定影响，因为违法建筑本身就不受法律保护。
- 如果受损房屋属于历史建筑或文物保护单位：如果受损房屋属于历史建筑或文物保护单位，那么修复工作可能需要遵循特定的法律程序和标准。在这种情况下，协商修复的合法性也需要结合相关法律法规进行判断。
建议：在协商修复过程中，双方应保持冷静、理性，尊重对方的权益和利益诉求。如果无法自行协商解决纠纷，可以寻求第三方调解或向人民法院提起诉讼等法律途径来维护自己的合法权益。如果你有具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。