结论：行政机关在行政诉讼中确实承担举证责任，这是基于“谁主张，谁举证”原则在行政诉讼中的特殊体现，即“被告对作出的行政行为负有举证责任”。在庭审辩论中，应围绕行政机关是否充分履行了举证责任，以及所举证据是否合法、真实、有效来展开。
一、法条依据
《中华人民共和国行政诉讼法》第三十四条：被告对作出的行政行为负有举证责任，应当提供作出该行政行为的证据和所依据的规范性文件。被告不提供或者无正当理由逾期提供证据，视为没有相应证据。但是，被诉行政行为涉及第三人合法权益，第三人提供证据的除外。
《最高人民法院关于行政诉讼证据若干问题的规定》第一条：根据行政诉讼法第三十二条和第四十三条的规定，被告对作出的具体行政行为负有举证责任，应当在收到起诉状副本之日起十日内，提供据以作出被诉具体行政行为的全部证据和所依据的规范性文件。被告不提供或者无正当理由逾期提供证据的，视为被诉具体行政行为没有相应的证据。
二、庭审辩论要点
行政机关举证责任的履行情况：
- 辩论时，首先应审查行政机关是否在法定期限内提交了全部证据和所依据的规范性文件。
- 若行政机关未提交或逾期提交，可主张其应承担不利法律后果，即视为被诉行政行为没有相应证据。
证据的合法性、真实性和有效性：
- 接着，应审查行政机关提交的证据是否合法取得，是否真实反映了案件事实，以及是否与被诉行政行为具有关联性。
- 若证据存在违法取得、虚假或无效等情况，可主张该证据不应被采纳，从而削弱行政机关的举证效果。
行政机关是否尽到说明义务：
- 行政机关在提交证据时，还应就证据的来源、内容及其与被诉行政行为的关系进行说明。
- 若行政机关未尽到说明义务，或说明不充分，可主张其未完全履行举证责任。
针对行政机关举证的反驳：
- 作为原告或第三人，在庭审辩论中还可以针对行政机关的举证提出反驳意见，如指出证据之间的矛盾、证据与案件事实的不符等。
- 通过反驳，可以进一步削弱行政机关的举证效果，甚至推翻其行政行为。
三、可能承担的法律后果
- 若行政机关未能充分履行举证责任，或所举证据存在合法性、真实性和有效性问题，法院可能判决撤销或部分撤销被诉行政行为，或判决行政机关重新作出行政行为。
- 在某些情况下，若行政机关的举证行为严重违法或构成滥用职权，还可能面临行政处分或刑事责任。
四、建议
- 在参与行政诉讼时，应充分了解行政机关的举证责任及相关法律规定，以便在庭审辩论中有效维护自己的合法权益。
- 若对行政机关的举证存在疑问或反驳意见，应及时向法院提出，并附上相关证据和法律依据。
如有任何进一步的问题或需要更详细的法律解释，请直接向我咨询。