结论：公司有案件纠纷时，一般不能直接注销，但存在特定情形下可注销的情况。以下从不同角度进行分析：
一、一般情况：案件纠纷未解决，公司不能注销
法律依据：
- 根据《中华人民共和国公司法》及相关司法解释，公司在注销前需完成清算程序，包括清理公司财产、编制资产负债表和财产清单、通知债权人申报债权等。若公司存在未了结的案件纠纷，尤其是涉及债权债务关系的纠纷，清算程序将无法顺利进行，因为债权人的权益可能无法得到保障。
法律后果：
- 若公司在案件纠纷未解决的情况下强行注销，可能面临法律责任。例如，债权人可能向法院申请撤销公司注销登记，恢复公司法人资格，以便继续追究其法律责任。此外，公司股东或清算组成员也可能因未履行清算义务而承担赔偿责任。
二、特定情形：案件纠纷不影响注销的情况
纠纷已得到妥善处理：
- 如果公司已经与纠纷对方达成和解协议，或者法院已经作出终审判决并执行完毕，且公司已经履行了所有法律义务，那么在这种情况下，公司可以依法进行注销。
纠纷不影响清算程序：
- 在某些情况下，虽然公司存在案件纠纷，但该纠纷并不涉及公司的核心资产或债权债务关系，或者纠纷的解决不会对公司清算程序产生实质性影响。在这种情况下，公司可以在确保纠纷不影响清算程序的前提下，依法进行注销。但这种情况较为罕见，且需要谨慎评估。
法院或仲裁机构出具相关证明：
- 如果公司能够提供法院或仲裁机构出具的证明文件，证明纠纷已经得到妥善处理或者不会对公司注销产生影响，那么公司可能可以在这种情况下进行注销。但这种情况需要具体分析证明文件的效力和内容。
三、法律建议
全面评估纠纷情况：
- 在考虑注销公司前，应全面评估公司存在的案件纠纷情况，包括纠纷的性质、涉及金额、解决进度等。如果纠纷复杂或涉及金额较大，建议咨询专业律师以获取更准确的法律意见。
确保清算程序合法合规：
- 如果决定注销公司，应确保清算程序合法合规。这包括成立清算组、通知债权人申报债权、清理公司财产等步骤。同时，应妥善处理与纠纷相关的债权债务关系，确保债权人的权益得到保障。
咨询专业律师：
- 由于公司注销涉及复杂的法律程序和可能的法律责任，建议在注销前咨询专业律师。律师可以根据公司的具体情况提供针对性的法律建议，帮助公司规避法律风险并顺利完成注销程序。
进一步思考：公司注销是一个复杂的法律过程，涉及多个方面的法律问题和责任。在存在案件纠纷的情况下，公司应谨慎评估注销的可行性和风险，并咨询专业律师以获取准确的法律意见。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。