在刑事诉讼中，书记员的回避决定权通常归属于法院院长，但具体情形需结合诉讼阶段和实际情况来分析。以下是对此问题的详细解答：
一、审判阶段书记员回避的决定权
在审判阶段，如果当事人或其法定代理人认为书记员存在可能影响公正审判的情形，如与案件有利害关系、是当事人的近亲属等，可以向法院提出回避申请。根据《中华人民共和国刑事诉讼法》及相关司法解释的规定，书记员的回避问题参照审判人员的回避规定执行，即由法院院长决定。法院院长在收到回避申请后，会进行审查，并根据具体情况决定是否支持回避申请。
二、检察阶段书记员回避的决定权（虽不直接决定，但需了解）
虽然刑事诉讼的主要回避决定权在审判阶段由法院院长行使，但在检察阶段，如果涉及书记员的回避问题，理论上应由检察长决定。不过，在实际操作中，检察阶段的书记员回避情况相对较少，且通常与检察人员的回避一并考虑。但需明确的是，在大多数刑事诉讼场景下，我们更关注的是审判阶段书记员的回避问题。
三、回避申请的提出与决定流程
申请提出：当事人或其法定代理人认为书记员存在应回避的情形时，可以向法院提出回避申请。申请可以口头或书面形式提出，并需说明具体的回避理由。
审查与决定：法院收到回避申请后，会进行审查。审查过程中，法院可能会要求申请人提供相关证据或材料，以支持其回避申请。法院院长在审查完毕后，会根据实际情况作出是否准许回避的决定。
执行与复议：如果法院院长决定准许回避，被决定回避的书记员应当立即退出案件的审理工作。如果当事人或其法定代理人对驳回申请回避的决定不服，可以在接到决定时申请复议一次。
四、特殊情况的处理
在刑事诉讼中，有时会出现一些特殊情况，如紧急侦查、秘密侦查等。在这些情况下，为了维护诉讼程序的连续性和稳定性，规定在回避决定作出前，被申请回避的人员（包括书记员）不得停止对案件的侦查或审理工作。但这一规定并不影响回避申请的提出和审查过程。
五、法律建议
及时提出回避申请：如果当事人或其法定代理人认为书记员存在应回避的情形，应及时向法院提出回避申请，以免影响案件的公正审理。
提供充分证据：在提出回避申请时，应尽可能提供充分的证据或材料，以支持其回避申请。这有助于法院更快地作出决定，并减少不必要的争议。
遵守法律程序：在回避申请的提出、审查、决定和执行过程中，应严格遵守法律程序。这有助于维护诉讼程序的公正性和合法性。
作为专业律师，我建议你在遇到刑事诉讼中书记员回避的问题时，及时咨询专业律师（即我本人）以获取更具体的法律建议。如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。