关于“书记批示要不要执行，合不合法由谁认定”的问题，我的结论是：书记的批示是否需要执行以及其合法性，需根据具体情况和法律规定来判断，合法性的认定通常由有权机关或司法机关进行。
一、书记批示的执行问题
批示的性质：
- 书记的批示，如果是基于其职务权限，对特定事项作出的指示或要求，通常具有一定的行政效力或指导意义。
- 如果批示内容属于具体行政行为，如要求某部门执行某项任务或处理某件事情，那么该批示应当被执行，除非存在违法或不合理的情况。
执行的前提：
- 批示内容必须合法，不得违反法律法规的规定。
- 批示应当在其职务权限范围内作出，不得超越职权。
- 如果批示涉及公民、法人或其他组织的合法权益，应当确保程序正当，保障其合法权益不受侵害。
不执行的后果：
- 如果无正当理由不执行书记的合法批示，可能会构成失职或渎职行为，需要承担相应的法律责任。
- 如果批示内容违法或不合理，执行批示可能会引发法律纠纷或不良后果，此时应当通过合法途径提出异议或申请复议。
二、书记批示的合法性认定
认定主体：
- 合法性的认定通常由有权机关或司法机关进行。例如，如果批示内容涉及行政处罚或行政强制措施，其合法性可能由上级行政机关或法院进行审查。
- 在某些情况下，如果批示内容涉及公民、法人或其他组织的合法权益，且存在争议，也可以通过行政复议或行政诉讼等途径进行合法性审查。
认定标准：
- 合法性认定主要依据法律法规的规定，判断批示内容是否违反法律、法规或规章的规定。
- 同时，也会考虑批示是否在其职务权限范围内作出，以及是否遵循了正当程序等原则。
认定程序：
- 如果对书记批示的合法性存在争议，通常可以通过向上级机关反映、申请行政复议或提起行政诉讼等途径进行解决。
- 在认定过程中，有权机关或司法机关会依法进行审查，并作出相应的决定或判决。
三、具体建议
对于执行者：
- 在执行书记批示前，应当仔细审查批示内容的合法性和合理性。
- 如果对批示内容存在疑问或异议，应当及时向上级机关或相关部门反映，并寻求法律意见或指导。
对于公民、法人或其他组织：
- 如果认为书记的批示侵犯了其合法权益，可以通过合法途径提出异议或申请复议。
- 在维护自身权益的过程中，应当保留好相关证据，以便在需要时进行证明。
如果您对书记批示的执行或合法性认定问题有进一步的疑问或需要具体的法律帮助，请直接向我咨询。 我将根据您的具体情况和法律法规的规定，为您提供专业的法律意见和帮助。