结论：没有证据而仅凭怀疑公司水杯长期被人下药就报警，这一行为本身并不违法，但可能因缺乏证据而无法有效推进案件调查，甚至可能因报假警而承担一定责任。以下从多个角度进行详细分析：

一、报警行为的合法性

1. 公民的报警权利：根据我国相关法律规定，公民有权利向公安机关报案，反映自己认为可能存在的违法犯罪行为。这是公民参与社会治安管理、维护自身合法权益的重要途径。因此，从法律层面讲，您有权就怀疑公司水杯长期被人下药的情况向公安机关报警。

2. 报警内容的真实性要求：虽然公民有报警的权利，但报警内容应当基于真实情况或合理怀疑。如果您仅凭无端的猜测或没有证据支持的怀疑就报警，可能会给公安机关的调查工作带来困扰，甚至浪费警力资源。

二、缺乏证据的影响

1. 调查难度增加：在没有证据的情况下，公安机关的调查工作将面临很大困难。他们需要花费更多时间和精力去收集证据、查明事实真相。如果最终无法找到确凿证据，案件可能无法得到有效处理。

2. 报假警的法律责任：如果您故意捏造事实、虚构情节报假警，干扰公安机关正常工作秩序，或者对他人造成不良影响，根据《中华人民共和国治安管理处罚法》的相关规定，您可能会面临警告、罚款甚至拘留等行政处罚。

三、建议与措施

1. 收集证据：在报警之前，建议您尽可能收集相关证据，如水杯中的残留物、监控录像、同事证言等。这些证据将有助于公安机关更准确地了解情况，开展调查工作。

2. 合理怀疑与谨慎报警：在怀疑公司水杯长期被人下药的情况下，您可以先进行一定的调查和了解，确认是否存在合理的怀疑依据。如果怀疑依据充分，再向公安机关报警；如果怀疑依据不足或存在误解，建议通过内部沟通或协商解决问题。

3. 配合公安机关调查：如果您已经报警，应当积极配合公安机关的调查工作，提供必要的协助和支持。同时，也要尊重公安机关的调查结果和处理意见。

总结与启示：没有证据而仅凭怀疑就报警并不违法，但可能因缺乏证据而无法有效推进案件调查。因此，在报警之前，建议您尽可能收集相关证据，确认怀疑依据的充分性。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。