针对你提出的“拉烟叶货主不认罪司机怎么办”的问题，首先我们要明确一点：司机在运输烟叶过程中的法律责任取决于其是否知情以及具体的行为情节。以下是我根据相关法律法规和律师见解为你提供的详细分析：

1. 司机不知情的情况：

   • 如果司机在完全不知情的情况下运输了烟叶，那么一般情况下，他不构成犯罪。这是因为司机没有主观上的故意，也没有参与非法经营的共谋。

2. 司机知情并参与运输的情况：

   • 如果司机明知是烟叶且没有准运证，却仍然为货主运输，那么他将需要承担行政责任。行政主管部门会没收其违法所得，并处罚款。
   • 如果司机明知烟叶的价值达到五万元以上，并且参与了非法运输，那么他可能构成非法经营罪。根据《刑法》的相关规定，非法经营罪是指违反国家规定，进行非法经营活动，扰乱市场秩序，情节严重的行为。

3. 司机应如何应对：

   • 如果司机确实不知情，他应该积极向执法部门说明情况，提供证据证明自己的无辜。
   • 如果司机知情但并未参与非法经营的共谋，他也应该如实向执法部门陈述事实，争取减轻或免除责任。
   • 在任何情况下，司机都应该配合执法部门的调查，如实提供相关信息和证据。

4. 法律建议：

   • 对于司机来说，最重要的是要增强法律意识，了解并遵守相关法律法规。
   • 在运输货物时，一定要确认货物是否合法，是否有相关的准运证等合法手续。
   • 如果遇到类似情况，司机应该及时咨询专业律师，了解自己的法律责任和应对策略。

综上所述，拉烟叶货主不认罪时，司机的法律责任取决于其是否知情以及具体的行为情节。司机应该根据自己的实际情况，积极应对执法部门的调查，并咨询专业律师以了解自己的法律责任和应对策略。如果你还有其他法律问题或需要进一步的帮助，请直接向我咨询。