结论：当男方与他人同居两年时，女方通常会提起民事诉讼来寻求离婚及相关权益的保护，而非刑事自诉。
分析说明：
民事诉讼角度：
- 根据《民法典》的相关规定，如果男方与他人同居，这构成了夫妻感情破裂的一种情形。女方可以以此为由向人民法院提起离婚诉讼，并要求分割夫妻共同财产、确定子女抚养权等。
- 在民事诉讼中，女方需要提供证据证明男方与他人同居的事实，以及这一事实对夫妻感情造成的破裂影响。法院在审理此类案件时，会进行调解，如果调解无效且确认感情确已破裂，将准予离婚。
刑事自诉角度：
- 刑事自诉通常涉及刑事犯罪行为，如重婚罪等。然而，在男方与他人同居的情况下，除非男方同时与他人以夫妻名义共同生活（即构成重婚），否则一般不构成刑事犯罪。
- 重婚罪的认定需要满足一定的条件，即男方必须明知他人有配偶而与之结婚，或者自己有配偶而与他人结婚。仅仅同居并不足以构成重婚罪，除非有证据表明他们以夫妻名义共同生活。
- 因此，在大多数情况下，女方不会因为男方与他人同居而提起刑事自诉。
特殊情况说明：
- 如果男方与他人同居的行为确实构成了重婚罪（即他们以夫妻名义共同生活），那么女方可以选择向公安机关报案，由公安机关立案侦查后，由检察院提起公诉。当然，女方也可以选择直接向人民法院提起刑事自诉，但这种情况相对较少见，且需要满足一定的条件。
行动建议：
- 如果你作为女方，发现男方与他人同居，并希望寻求法律帮助，建议你首先收集相关证据，如照片、视频、聊天记录等，以证明男方与他人同居的事实。
- 然后，你可以咨询专业律师（比如我），了解具体的法律程序和维权策略。律师将根据你的具体情况，为你提供个性化的法律建议，并帮助你制定合适的诉讼方案。
后续思考：
- 在处理此类案件时，除了关注法律程序外，还需要考虑如何保护自己的合法权益，如财产分割、子女抚养等。
- 同时，也要做好心理准备，因为离婚诉讼可能涉及复杂的情感纠葛和法律争议，需要耐心和毅力来应对。
希望以上分析能对你有所帮助。如果你有任何其他问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。