根据我国现行法律规定，公务员贪污1000元尚未达到刑事立案标准，但会面临行政纪律处分，具体处罚需结合情节严重程度、认错态度等因素综合判定。以下是详细分析：

一、刑事责任层面：未达立案标准，不构成犯罪

根据《刑法》第三百八十三条及《最高人民法院、最高人民检察院关于办理贪污贿赂刑事案件适用法律若干问题的解释》第一条，贪污罪的立案标准为3万元以上（特殊情形下为1万元以上，如贪污救灾款物等）。因此，贪污1000元的行为不构成刑事犯罪，不会面临有期徒刑、拘役等刑事处罚。

二、行政纪律处分层面：可能面临警告至开除的处罚

虽然不构成犯罪，但公务员贪污行为违反《公务员法》第五十九条及《行政机关公务员处分条例》第二十三条，属于“贪污、贿赂、利用职务之便为自己或者他人谋取私利”的违纪行为。根据情节轻重，可能受到以下处分：

1. 警告：适用于情节较轻、认错态度好、未造成严重后果的情况，处分期限为6个月；
2. 记过：情节稍重，如多次贪污、影响单位声誉等，处分期限为12个月；
3. 记大过：情节较重，如贪污款项用于个人挥霍、引发群众投诉等，处分期限为18个月；
4. 降级/撤职：情节严重，如贪污行为导致公共财产损失、社会影响恶劣等，可能降低职务级别或直接撤职；
5. 开除：情节特别严重，如贪污后拒不退还、伪造证据对抗调查等，可能被直接开除公职。

关键点：行政处分的具体档次需结合贪污次数、金额用途、是否主动退还、是否造成损失等因素综合判定。例如，若公务员主动退还1000元并深刻检讨，可能仅受警告处分；若拒不承认且态度恶劣，则可能面临开除。

三、其他潜在后果

1. 党纪处分：若为中共党员，还可能面临《中国共产党纪律处分条例》中的警告至开除党籍处分；
2. 职业限制：被开除公职后，未来5年内不得重新考录公务员，且部分行业（如金融、法律）可能对有违纪记录的人员设置准入限制；
3. 社会评价影响：处分记录会存入个人档案，可能影响晋升、评优等职业发展。

建议

若涉及具体案件，建议提供更多细节（如贪污次数、款项用途、是否主动退还等），以便进一步分析处罚可能性。如有疑问，可直接向我咨询，我会结合实务经验为您详细解答。