结论前置：在合同中约定了有效仲裁条款的情况下，当事人应当首先通过仲裁方式解决纠纷，而不应直接向法院起诉。若未经仲裁直接起诉，法院通常不会受理，但存在特殊情形时除外。以下是对这一结论的详细解释：

一、仲裁协议的法律效力

根据我国《仲裁法》和《民事诉讼法》的相关规定，一旦合同双方达成了有效的仲裁协议，该协议即具有排除法院管辖权的法律效力。这意味着，在发生纠纷时，当事人应当首先依据仲裁协议向选定的仲裁委员会申请仲裁，而不是直接向人民法院提起诉讼。这是仲裁协议的基本法律效力，也是当事人选择仲裁作为纠纷解决方式的重要前提。

二、有效的仲裁协议要件

一个有效的仲裁协议需要具备以下法定内容：

1. 请求仲裁的意思表示：即双方当事人明确表示愿意通过仲裁方式解决纠纷。
2. 明确的仲裁事项：即双方当事人需要明确约定仲裁的具体事项，如合同履行、违约责任等。
3. 选定的仲裁委员会：即双方当事人需要明确约定仲裁机构，以便在发生纠纷时能够确定具体的仲裁机构进行仲裁。

只有当这些要素齐全且符合法律规定时，仲裁协议才能被视为有效，并对当事人产生约束力。

三、特殊情况下的处理

尽管仲裁协议具有排除法院管辖权的法律效力，但在某些特殊情况下，当事人仍然可以向法院提起诉讼：

1. 仲裁协议无效：如果仲裁协议因某些原因（如约定的仲裁事项超出法律规定的仲裁范围、无民事行为能力人或限制民事行为能力人订立的仲裁协议、一方采取胁迫手段迫使对方订立仲裁协议等）被认定无效，那么当事人不再受仲裁协议的约束，可以向法院起诉。
2. 仲裁机构未受理仲裁申请：如果当事人已经按照仲裁协议向仲裁机构提出了仲裁申请，但仲裁机构以某种理由不受理该申请，那么在这种情况下，当事人也可以向法院提起诉讼。
3. 仲裁条款或协议不成立、失效或内容不明确：除了上述两种情况外，如果仲裁条款或协议因其他原因（如不成立、失效或内容不明确无法执行等）不能得到有效执行，当事人同样有权向法院提起诉讼。

四、法律建议

1. 在签订合同时明确约定仲裁条款：为了避免后续纠纷解决过程中的不必要的麻烦和损失，建议双方在签订合同时就明确约定仲裁条款，并确保仲裁协议的有效性。
2. 在发生纠纷时及时咨询专业律师：如果在实际操作中遇到任何问题或疑问，比如仲裁协议是否有效、仲裁机构是否受理等，建议及时向我咨询，以获取准确的法律意见和帮助。

举例说明：假设甲乙双方签订了一份建设工程合同，并在合同中约定了“因本合同产生的任何争议，均应提交至XX仲裁委员会进行仲裁”。后来，双方因合同履行问题产生了争议。在这种情况下，甲乙双方应当首先依据合同中的仲裁条款，向XX仲裁委员会申请仲裁，而不是直接向法院起诉。如果甲乙双方未经仲裁直接向法院起诉，法院将不会受理该案件。但是，如果仲裁协议被认定无效或者仲裁机构未受理仲裁申请等特殊情况发生，甲乙双方则有权向法院提起诉讼。