两家公司的货款让第三家公司代付，这一行为本身并不直接构成违法，但需要满足一定的条件并注意潜在的法律风险。以下从不同角度为您详细分析：
一、合法性角度
合同相对性原则：
- 通常情况下，合同具有相对性，即合同的权利和义务仅对合同双方产生约束力。在货款支付问题上，如果原始合同（如买卖合同）中并未约定可以由第三家公司代付货款，那么原则上应由合同中的买方（即债务人）直接支付给卖方（即债权人）。
- 然而，如果合同双方（即买卖双方）在合同中明确约定了可以由第三家公司代付货款，或者事后达成了这样的补充协议，并且这一安排没有违反法律法规的强制性规定，那么第三家公司代付货款就是合法的。
第三方代付的法律性质：
- 第三方代付可以视为一种债务承担或债务转移的行为，但需要得到债权人的同意。如果债权人（即卖方）同意由第三家公司代付货款，并且这一安排没有损害债权人的利益，那么这种代付行为就是有效的。
二、潜在法律风险角度
税务风险：
- 如果第三家公司代付货款的行为被税务机关认定为“代收代付”，并且没有按照相关规定进行税务处理（如开具正确的发票、申报纳税等），那么可能面临税务风险，包括被税务机关处罚等。
- 因此，在进行第三方代付时，应确保税务处理的合规性，避免不必要的税务纠纷。
合同履行风险：
- 如果第三家公司代付货款后，买方（即原始债务人）与卖方之间因合同履行问题产生纠纷（如货物质量问题、交货时间问题等），那么第三家公司可能因代付行为而卷入纠纷之中。
- 因此，在进行第三方代付前，应确保合同双方对合同履行问题有明确的约定，并且第三家公司对合同履行情况有充分的了解。
资金安全风险：
- 如果第三家公司代付货款后，因自身经营问题（如破产、倒闭等）导致无法继续履行代付义务，那么卖方的货款可能面临无法收回的风险。
- 因此，在选择第三家公司进行代付时，应对其资信状况进行充分的调查和评估。
三、建议与措施
完善合同条款：
- 在原始合同中明确约定是否可以由第三家公司代付货款，以及代付的具体条件和程序。
- 如果事后需要变更支付方式，应签订补充协议并得到合同双方的同意。
确保税务合规：
- 在进行第三方代付时，应确保按照相关规定进行税务处理，如开具正确的发票、申报纳税等。
- 可以咨询专业税务机构或律师，以确保税务处理的合规性。
评估第三家公司资信：
- 在选择第三家公司进行代付前，应对其资信状况进行充分的调查和评估，包括其经营状况、财务状况、信誉状况等。
- 可以要求第三家公司提供相关的资信证明文件或进行实地考察。
保留相关证据：
- 在进行第三方代付时，应保留好相关的证据材料，如合同、补充协议、代付凭证、发票等。
- 这些证据材料在后续可能发生的纠纷中具有重要的证明作用。
总结来说，两家公司的货款让第三家公司代付并不直接违法，但需要满足一定的条件并注意潜在的法律风险。如果您在实际操作中遇到任何问题或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。