结论：在刑事案件的三个阶段中，如果第二阶段更换律师，律师费是否退还主要取决于双方签订的委托合同中的约定以及律师实际完成的工作量。
详细分析：
合同约定：
- 在大多数情况下，律师费的退还问题会在委托合同中明确约定。如果合同中规定了因客户原因更换律师时律师费的退还比例或方式，那么应当按照合同约定执行。
- 如果合同中没有明确约定，或者约定不明确，那么就需要根据律师实际完成的工作量以及行业惯例来协商确定。
律师实际完成的工作量：
- 律师在刑事案件的每个阶段都承担着不同的职责和任务。如果律师在第一阶段已经完成了大量的工作，如会见犯罪嫌疑人、了解案情、收集证据等，那么即使第二阶段更换律师，原律师也有权根据其实际完成的工作量收取相应的费用。
- 如果律师在第一阶段的工作量相对较少，或者客户认为律师的工作没有达到预期效果，那么在更换律师时，双方可以协商退还部分律师费。
行业惯例与公平原则：
- 在律师行业中，通常会有一定的行业惯例来处理类似情况。例如，有些律师事务所可能会规定，如果客户在案件进行过程中更换律师，那么原律师将按照其实际完成的工作量收取费用，并退还剩余部分的律师费。
- 同时，根据公平原则，如果律师没有完成其应当完成的工作，或者客户因为律师的原因而遭受了损失，那么律师应当承担相应的责任，包括退还部分或全部律师费。
建议：
- 查看合同：首先，建议您仔细查看与律师签订的委托合同，了解其中关于律师费退还的约定。
- 与律师协商：如果合同中没有明确约定或者约定不明确，建议您与原律师进行协商，根据其实际完成的工作量以及行业惯例来确定律师费的退还问题。
- 寻求法律援助：如果双方无法达成一致意见，您可以考虑寻求法律援助或者咨询其他专业律师的意见，以维护自己的合法权益。
后续行动：
- 如果您决定更换律师，请确保与新律师签订详细的委托合同，明确双方的权利和义务，包括律师费的支付方式和退还条件等。
- 在与原律师协商律师费退还问题时，请保持冷静和理性，以达成双方都能接受的解决方案。
如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。