农村土地转让协议一式两份都单方签字不合法，该协议未成立，不产生法律效力。具体分析如下：

1. 合同成立的基本要件：根据《民法典》第四百九十条，合同自双方当事人签字或盖章时成立。农村土地转让协议作为合同的一种，必须满足双方签字或盖章的形式要件。若仅一方签字，另一方未签字，则合同未成立，不产生法律效力。

2. 单方签字的法律后果：

   • 协议未生效：单方签字的协议因缺乏另一方的意思表示，无法形成合意，因此协议未生效。
   • 无约束力：由于协议未成立，对双方均无法律约束力。任何一方均不能依据该协议主张权利或要求对方履行义务。

3. 特殊情况下的例外：

   • 追认：若未签字方事后以书面或口头形式明确表示同意该协议内容，可视为对协议的追认，此时协议自追认时生效。但需注意，追认必须明确且无歧义。
   • 实际履行：若双方已按照协议内容实际履行，且未签字方未提出异议，可能视为双方以实际行为达成合意。但此情形需结合具体证据综合判断，且存在法律风险。

4. 风险提示：

   • 土地流转合规性：农村土地流转需符合《土地管理法》《农村土地承包法》等法律法规的规定，如需经发包方同意或备案等。单方签字的协议可能因违反法定程序而无效。
   • 权益保护：建议双方在签订协议时，务必确保双方均签字或盖章，并保留好协议原件。若一方拒绝签字，应及时通过书面形式明确拒绝原因，避免后续纠纷。

建议：若您涉及农村土地转让事宜，务必确保协议双方均签字或盖章，并符合相关法律法规的规定。如有疑问，可直接向我咨询，我将为您提供专业、详细的法律解答。