结论：客户还有货款未付，而您还有3万多发票未开，这一行为本身并不直接构成违法，但可能涉及税务合规风险及合同履行问题，需根据具体情况分析。
一、税务合规角度
发票开具义务：
- 根据《中华人民共和国发票管理办法》第十九条，销售商品、提供服务以及从事其他经营活动的单位和个人，对外发生经营业务收取款项，收款方应当向付款方开具发票。因此，在客户已支付货款或您已收到货款的情况下，您有义务向客户开具发票。
未开发票的风险：
- 若您未按照规定开具发票，可能面临税务机关的处罚，包括罚款等。同时，这也可能影响您的税务信用评级，对未来的税务合规和经营活动产生不利影响。
- 对于客户而言，未取得发票可能导致其无法进行正常的税务抵扣，进而增加其税务成本。
合规建议：
- 建议您尽快与客户沟通，明确货款支付情况，并在收到货款后及时开具发票。
- 若客户尚未支付货款，您可在合同中约定发票开具与货款支付的条件，以避免潜在的税务风险。
二、合同履行角度
合同义务：
- 在货物买卖合同中，您作为卖方，有义务按照合同约定交付货物并开具发票。客户作为买方，则有义务按照合同约定支付货款。
未开发票与货款支付的关系：
- 发票开具与货款支付是合同中的两项独立义务。除非合同中有特别约定，否则一方未履行其中一项义务，并不直接影响另一方履行其义务。
- 因此，即使您尚未开具发票，客户仍应按照合同约定支付货款。同样，即使客户尚未支付货款，您也应按照合同约定开具发票（除非合同中有相反约定）。
合同纠纷处理：
- 若客户以未开具发票为由拒绝支付货款，您可依据合同约定及法律规定，通过协商、调解、仲裁或诉讼等方式解决纠纷。
- 在处理纠纷时，您应保留好相关证据，如合同、发货单、对账单等，以证明您已履行合同义务或客户未履行合同义务。
三、综合建议
沟通协商：
- 建议您首先与客户进行沟通协商，明确货款支付和发票开具的时间节点和条件，以达成双方都能接受的解决方案。
完善合同条款：
- 在未来的合同中，建议您明确约定发票开具与货款支付的条件和顺序，以避免类似的纠纷再次发生。
寻求法律帮助：
- 若您在处理此类问题时遇到困难或疑问，可直接向我咨询。我将根据您的具体情况提供专业的法律建议和帮助。
总之，虽然未开具发票本身并不直接构成违法，但可能涉及税务合规风险及合同履行问题。因此，建议您尽快与客户沟通并妥善处理相关事宜。