结论：公司被罚款后若无力偿还，工程款是否会被冻结需分情况讨论，主要取决于罚款执行程序与工程款性质。以下从不同角度展开分析：

1. 罚款执行与财产冻结的法定程序

根据《行政处罚法》及《民事诉讼法》，行政机关对公司作出罚款决定后，若公司未在法定期限内缴纳，行政机关可申请法院强制执行。此时，法院会依法查封、扣押、冻结公司名下财产，但需满足以下条件：

• 财产范围：法院冻结的财产应为公司名下合法财产，且需与罚款金额相当（避免超标的冻结）。
• 执行顺序：若公司同时存在多个债务（如工程款、员工工资、银行贷款等），法院会根据《企业破产法》或《民事诉讼法》规定的清偿顺序处理。通常，员工工资、社保费用等优先于普通债权（如工程款）受偿。

关键点：工程款是否被冻结，取决于其是否被认定为“公司财产”及法院执行时的具体操作。若工程款尚未支付给承包方（即仍属于公司债务），则可能被纳入冻结范围；若已支付或承包方享有优先受偿权（如建设工程价款优先受偿权），则可能不受影响。

2. 工程款的特殊保护：建设工程价款优先受偿权

根据《民法典》第807条，承包方对建设工程价款享有优先受偿权，且该权利优先于抵押权和其他债权。这意味着：

• 优先受偿范围：仅限于“建设工程价款”，包括人工、材料、机械等直接成本，但不包括逾期支付利息、违约金等。
• 行使条件：承包方需在发包人逾期支付工程款后，通过协商或诉讼方式主张权利，并在法定期限内（通常为6个月）行使优先受偿权。

关键点：若承包方依法主张了优先受偿权，即使公司被罚款且财产被冻结，工程款仍可能优先于罚款受偿。但需注意，优先受偿权需通过法律程序确认，否则可能被视为普通债权。

3. 公司无力偿还罚款的替代方案

若公司确实无力偿还罚款，可尝试以下途径：

• 申请延期或分期缴纳：根据《行政处罚法》第72条，公司可向行政机关申请延期或分期缴纳罚款，需提供财务困难证明（如资产负债表、审计报告等）。
• 协商和解：与行政机关协商，通过提供担保、以物抵债等方式履行义务。
• 破产清算或重整：若公司资不抵债，可依法申请破产。在破产程序中，罚款属于普通债权，清偿顺序靠后，可能无法全额受偿。

关键点：这些方案需以公司主动沟通为前提，且需符合法定条件。若公司消极应对，罚款可能通过强制执行程序影响工程款支付。

4. 实务建议

• 对承包方：
  • 及时签订书面合同，明确工程款支付条款及违约责任。
  • 关注公司财务状况，若发现其可能无力支付工程款，尽早主张优先受偿权。
  • 在法院冻结财产前，申请诉前财产保全或诉讼保全，确保工程款安全。
• 对公司：
  • 积极与行政机关沟通，争取延期或分期缴纳罚款。
  • 梳理资产与债务，优先保障员工工资、社保等法定优先债权。
  • 避免转移、隐匿财产，否则可能面临更严厉的法律责任（如拒不执行判决、裁定罪）。

总结：工程款是否会被冻结需结合罚款执行程序、工程款性质及公司财务状况综合判断。若您是承包方，建议尽快通过法律手段确认优先受偿权；若您是公司方，建议主动与行政机关协商解决方案。如有进一步疑问，可直接向我咨询具体操作细节。